More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2095 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  100 
 
 
484 aa  994    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  39.78 
 
 
665 aa  352  8e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  42.04 
 
 
651 aa  349  6e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  43.94 
 
 
432 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  42.64 
 
 
434 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  42.2 
 
 
434 aa  310  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  43.43 
 
 
432 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  43.43 
 
 
432 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  43.43 
 
 
432 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  42.2 
 
 
433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  43.18 
 
 
432 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  42.38 
 
 
434 aa  309  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  42.38 
 
 
434 aa  309  9e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  41.94 
 
 
434 aa  302  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  38.76 
 
 
818 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  30.85 
 
 
1012 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  31.11 
 
 
597 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  32.97 
 
 
603 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  30.77 
 
 
574 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  31.65 
 
 
361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  27.94 
 
 
1007 aa  152  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.55 
 
 
1018 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  28.93 
 
 
966 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  30.59 
 
 
793 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  29.63 
 
 
452 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  29.63 
 
 
428 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.15 
 
 
953 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  29.31 
 
 
717 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.32 
 
 
582 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  28.83 
 
 
990 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  29.41 
 
 
566 aa  144  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  29.21 
 
 
790 aa  140  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  29.52 
 
 
796 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  29.52 
 
 
796 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  30.22 
 
 
792 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  29.49 
 
 
360 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  27.78 
 
 
785 aa  133  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  27.95 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  29.21 
 
 
591 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  27.55 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  28.88 
 
 
434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  26.82 
 
 
416 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  28.74 
 
 
395 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  25.18 
 
 
1003 aa  126  9e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  26.6 
 
 
392 aa  126  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  28.03 
 
 
784 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  26.46 
 
 
531 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  28.86 
 
 
357 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  29.06 
 
 
354 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  29.55 
 
 
366 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  26.83 
 
 
391 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  28.14 
 
 
430 aa  124  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  25.79 
 
 
408 aa  124  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.65 
 
 
1002 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  25.27 
 
 
390 aa  120  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  27.51 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  27.36 
 
 
971 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  27.76 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  26.21 
 
 
483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  28.65 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  26.54 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  25.86 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  27.56 
 
 
459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  24.87 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  25.12 
 
 
528 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  25.12 
 
 
528 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  27.71 
 
 
381 aa  113  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  26.36 
 
 
381 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  28 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  27.81 
 
 
348 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  26.34 
 
 
992 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  29.17 
 
 
338 aa  110  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  27.11 
 
 
997 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  25.68 
 
 
397 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  25.99 
 
 
547 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  26.45 
 
 
351 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  27.3 
 
 
375 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  25.5 
 
 
379 aa  107  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  23.37 
 
 
394 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  24.56 
 
 
423 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  22.88 
 
 
496 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.38 
 
 
976 aa  97.1  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  27.27 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  28.09 
 
 
337 aa  94.7  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  25.31 
 
 
344 aa  94  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  33.51 
 
 
446 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  24.57 
 
 
447 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  26.56 
 
 
371 aa  91.7  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  25.73 
 
 
433 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  24.6 
 
 
420 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  25.7 
 
 
517 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  26.09 
 
 
339 aa  87.4  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  23.53 
 
 
485 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  23.53 
 
 
485 aa  87  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  23.53 
 
 
485 aa  87  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  23.08 
 
 
424 aa  87  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  23.53 
 
 
485 aa  87  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  33.16 
 
 
1032 aa  86.7  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  23.56 
 
 
415 aa  86.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  22.68 
 
 
424 aa  86.7  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>