More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2622 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  72.69 
 
 
434 aa  674    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  99.31 
 
 
432 aa  881    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  72.22 
 
 
434 aa  669    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  72.92 
 
 
434 aa  675    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  99.31 
 
 
432 aa  881    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  98.84 
 
 
432 aa  877    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  72.92 
 
 
434 aa  674    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  886    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  98.84 
 
 
432 aa  879    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  72.45 
 
 
434 aa  671    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  72.92 
 
 
433 aa  675    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  46.83 
 
 
651 aa  397  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  48.15 
 
 
665 aa  387  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  43.94 
 
 
484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  42.37 
 
 
818 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  33.16 
 
 
574 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  34 
 
 
452 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  34.84 
 
 
428 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  35.45 
 
 
1012 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  32.55 
 
 
966 aa  186  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  30.35 
 
 
717 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  34.71 
 
 
591 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  31.24 
 
 
597 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  34.14 
 
 
603 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  31.67 
 
 
566 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.68 
 
 
582 aa  173  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.82 
 
 
1018 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 
953 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  30.11 
 
 
361 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.27 
 
 
1002 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  29.79 
 
 
379 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  28.84 
 
 
1007 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  31.52 
 
 
395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  30.65 
 
 
793 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  29.44 
 
 
391 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  30.16 
 
 
796 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  30.16 
 
 
796 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  31.58 
 
 
360 aa  143  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  32.35 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  32.48 
 
 
792 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  29.37 
 
 
385 aa  141  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  30.59 
 
 
379 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  29.47 
 
 
990 aa  139  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  29.48 
 
 
379 aa  137  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  28.39 
 
 
408 aa  137  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  30.53 
 
 
784 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  28.67 
 
 
447 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  32.15 
 
 
785 aa  136  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  31.73 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  29.82 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  29.13 
 
 
992 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  30.53 
 
 
361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  31.29 
 
 
790 aa  133  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  30.36 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  29.7 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  28.29 
 
 
971 aa  130  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  29.76 
 
 
416 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  31.6 
 
 
390 aa  129  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  31.11 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  26.88 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  32.38 
 
 
366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  30.57 
 
 
459 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  30.09 
 
 
381 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  30.33 
 
 
357 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  31.29 
 
 
415 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  30.99 
 
 
483 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  31.55 
 
 
337 aa  124  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  28.43 
 
 
528 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  28.43 
 
 
528 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  28.92 
 
 
531 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  31.43 
 
 
334 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  27.53 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.38 
 
 
976 aa  117  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  29.34 
 
 
348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  27.87 
 
 
351 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  27.8 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  28.61 
 
 
997 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  26.05 
 
 
1003 aa  115  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  29.22 
 
 
547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  28.24 
 
 
397 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  28.64 
 
 
424 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  25.12 
 
 
424 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  27.58 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  26.49 
 
 
496 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  26.9 
 
 
433 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  31.15 
 
 
369 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  26.49 
 
 
613 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  25.06 
 
 
431 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  26.65 
 
 
424 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  26.2 
 
 
420 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  28.01 
 
 
427 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  24.94 
 
 
424 aa  104  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  27.09 
 
 
377 aa  103  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  26.51 
 
 
434 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  23.94 
 
 
406 aa  103  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.56 
 
 
505 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  25.79 
 
 
420 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  30.69 
 
 
344 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  25.89 
 
 
394 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  24.69 
 
 
438 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>