More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0011 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  100 
 
 		 427 aa  878    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  43.65 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  40.91 
 
 		 447 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  39.61 
 
 		 424 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  38.98 
 
 		 426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  35.29 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  33.02 
 
 		 414 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  37.27 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  33.57 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  33.1 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  32.26 
 
 		 445 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  33.09 
 
 		 405 aa  230  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  35.02 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  34.09 
 
 		 613 aa  222  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  33.09 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  33.17 
 
 		 414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  33.18 
 
 		 422 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  33.75 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  33.88 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  34.05 
 
 		 420 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  32.86 
 
 		 408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  34.79 
 
 		 407 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  33.02 
 
 		 424 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  31.93 
 
 		 420 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  32.47 
 
 		 370 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  34.27 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  34.06 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  33.02 
 
 		 424 aa  203  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  32.07 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  31.96 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  33.12 
 
 		 440 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  32.85 
 
 		 420 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  32.85 
 
 		 420 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  31.42 
 
 		 454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  31.65 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  33.17 
 
 		 427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  31.22 
 
 		 407 aa  196  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  32.57 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  31.15 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  31.77 
 
 		 417 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  30.4 
 
 		 399 aa  192  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  33.5 
 
 		 408 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  29.74 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  32.63 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  30.36 
 
 		 402 aa  190  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  33.25 
 
 		 422 aa  189  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  30.68 
 
 		 411 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  33.51 
 
 		 423 aa  189  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  32.18 
 
 		 395 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  31.55 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  31.44 
 
 		 406 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  32.01 
 
 		 400 aa  186  8e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  31.86 
 
 		 418 aa  186  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  31.91 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  31 
 
 		 438 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  28.54 
 
 		 399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  31.43 
 
 		 453 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  32.04 
 
 		 395 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  29.49 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  32.16 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  29.66 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  31.69 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  31.19 
 
 		 431 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  31.67 
 
 		 382 aa  177  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  30.48 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  31.03 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  29.47 
 
 		 438 aa  172  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  28.4 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  31.18 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  30.73 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  29.09 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  29.53 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  28.47 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  29.48 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  29.4 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  30.45 
 
 		 412 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  28.53 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  28.53 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  28.53 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  28.26 
 
 		 468 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  28.91 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  28.95 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  30.24 
 
 		 444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  28.81 
 
 		 440 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  29.21 
 
 		 396 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  29.92 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  28.46 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3034  beta-lactamase  28.97 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396527  normal  0.941046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  28 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  29.8 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  28.86 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  28.35 
 
 		 401 aa  147  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  28.61 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  28.85 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  30.36 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  30.46 
 
 		 431 aa  143  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  28.5 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  28.25 
 
 		 397 aa  143  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2275  beta-lactamase  29.35 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0956783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  28.57 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>