More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2687 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  100 
 
 		 381 aa  770    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  97.11 
 
 		 381 aa  727    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  62.47 
 
 		 391 aa  485  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  59.59 
 
 		 395 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  61.38 
 
 		 416 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  54.2 
 
 		 408 aa  368  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  50.94 
 
 		 392 aa  358  8e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  51.45 
 
 		 483 aa  329  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  52.33 
 
 		 459 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  44.27 
 
 		 793 aa  259  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  39.89 
 
 		 428 aa  245  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  41.34 
 
 		 452 aa  245  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  37.37 
 
 		 784 aa  215  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  34.59 
 
 		 528 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  34.59 
 
 		 528 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  38.14 
 
 		 390 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  34.22 
 
 		 531 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  38.86 
 
 		 796 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  38.86 
 
 		 796 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  37.95 
 
 		 966 aa  209  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  37.43 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  37.69 
 
 		 792 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  35.64 
 
 		 790 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  37.5 
 
 		 785 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  36.31 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  36.15 
 
 		 574 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  40.48 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  32.75 
 
 		 471 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  35.73 
 
 		 379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  31.6 
 
 		 496 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  33.72 
 
 		 379 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  34.04 
 
 		 430 aa  180  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  36.77 
 
 		 582 aa  176  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  31.08 
 
 		 597 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.71 
 
 		 1018 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  34.68 
 
 		 381 aa  172  9e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  33.88 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  35.76 
 
 		 717 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  35.28 
 
 		 366 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  33.71 
 
 		 381 aa  162  6e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  35.19 
 
 		 566 aa  162  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.8 
 
 		 953 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  29.95 
 
 		 1012 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  36.34 
 
 		 351 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  35.71 
 
 		 361 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  34.4 
 
 		 818 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  31.68 
 
 		 603 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1007 aa  150  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  38.23 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  37.88 
 
 		 591 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  33.53 
 
 		 360 aa  149  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.08 
 
 		 1002 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  30.56 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  33.13 
 
 		 361 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  28.35 
 
 		 990 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  30.61 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  28.84 
 
 		 651 aa  138  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  30.61 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  30.38 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  30.38 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  30.03 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  25.69 
 
 		 971 aa  136  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  34.45 
 
 		 357 aa  136  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  27.42 
 
 		 997 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  30.88 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  32.88 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  29.5 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  32.07 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  29.45 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  27.12 
 
 		 992 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  30 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  30 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  28.91 
 
 		 432 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3659  beta-lactamase  29.07 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  25.69 
 
 		 1003 aa  130  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  31.79 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  33.1 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  31.48 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  23.38 
 
 		 434 aa  125  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  35.42 
 
 		 334 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  29.67 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  34.33 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  30.89 
 
 		 414 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  26.36 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  33.66 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  30.97 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  29.54 
 
 		 406 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  31.34 
 
 		 407 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  26.34 
 
 		 665 aa  112  8.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  27.78 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  30.06 
 
 		 447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1130  beta-lactamase  28.33 
 
 		 355 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  29.51 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2590  beta-lactamase  34.67 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  31.74 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  27.7 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  29.27 
 
 		 364 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  28.31 
 
 		 395 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  28.53 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  30.09 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>