More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0637 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  100 
 
 
424 aa  877    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  44.95 
 
 
447 aa  339  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  44.01 
 
 
426 aa  329  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  42.72 
 
 
433 aa  323  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  40.38 
 
 
414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  39.95 
 
 
406 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  40.68 
 
 
405 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  40.68 
 
 
405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  41.4 
 
 
445 aa  284  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  40.36 
 
 
427 aa  282  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  39.86 
 
 
422 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  40.29 
 
 
420 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  39.95 
 
 
405 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  37.41 
 
 
419 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  38.82 
 
 
424 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  38.59 
 
 
424 aa  268  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  40.58 
 
 
370 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  39.52 
 
 
420 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  39.13 
 
 
399 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  38.86 
 
 
420 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  38.86 
 
 
420 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  37.8 
 
 
424 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  39.13 
 
 
399 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  38.01 
 
 
408 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  37.79 
 
 
411 aa  259  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  39.23 
 
 
407 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  37.03 
 
 
411 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  40.15 
 
 
407 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  37.04 
 
 
411 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  37.47 
 
 
420 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  38.83 
 
 
417 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  37.77 
 
 
418 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  38.2 
 
 
407 aa  253  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  36.62 
 
 
454 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  39.15 
 
 
438 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  38.11 
 
 
402 aa  250  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  38.39 
 
 
417 aa  248  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  37.65 
 
 
427 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  38.24 
 
 
414 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  39.32 
 
 
407 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  39.39 
 
 
407 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  41.24 
 
 
440 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  38.39 
 
 
453 aa  237  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  37.01 
 
 
415 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  35.52 
 
 
435 aa  233  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  38.35 
 
 
452 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  37.31 
 
 
409 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  36.86 
 
 
438 aa  230  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  37.05 
 
 
423 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  36.16 
 
 
438 aa  229  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  35.37 
 
 
422 aa  229  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  35.59 
 
 
408 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  35.61 
 
 
400 aa  220  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  35.08 
 
 
613 aa  217  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  34.94 
 
 
406 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  36.27 
 
 
430 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  33.33 
 
 
430 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  34.22 
 
 
431 aa  215  9e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  35.25 
 
 
410 aa  213  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  35.55 
 
 
414 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  34.5 
 
 
418 aa  210  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  33.86 
 
 
431 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  34.78 
 
 
440 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  35.04 
 
 
426 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  32.37 
 
 
425 aa  205  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  34.49 
 
 
412 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  31.77 
 
 
436 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  32.52 
 
 
422 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  33.87 
 
 
398 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  33.41 
 
 
444 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  33.59 
 
 
395 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  33.09 
 
 
437 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  33.94 
 
 
396 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  33.96 
 
 
409 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  33.95 
 
 
393 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  33.51 
 
 
391 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  32.04 
 
 
468 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  35.34 
 
 
401 aa  192  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  36.58 
 
 
401 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  33.96 
 
 
404 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  33.07 
 
 
389 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  35.45 
 
 
401 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  35.45 
 
 
401 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  34.13 
 
 
398 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  34.13 
 
 
398 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  35.31 
 
 
389 aa  186  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  35.48 
 
 
401 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  31.84 
 
 
395 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  31.33 
 
 
437 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  32.82 
 
 
393 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6825  beta-lactamase  32.98 
 
 
382 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  33.86 
 
 
398 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  32.43 
 
 
395 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  34.76 
 
 
401 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  33.07 
 
 
419 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  30.69 
 
 
395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  34.13 
 
 
397 aa  180  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5920  Beta-lactamase  34.04 
 
 
398 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  31.77 
 
 
382 aa  179  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  33.07 
 
 
396 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>