More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1560 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  100 
 
 		 412 aa  818    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  42.28 
 
 		 424 aa  306  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  41.23 
 
 		 420 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  43.45 
 
 		 408 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  40.86 
 
 		 422 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  43.9 
 
 		 417 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  43.73 
 
 		 370 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  41.29 
 
 		 420 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  40.62 
 
 		 424 aa  289  7e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  46.38 
 
 		 407 aa  289  8e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  43.57 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  40.88 
 
 		 418 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  44.31 
 
 		 405 aa  285  9e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  39.46 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  42.82 
 
 		 414 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  43.56 
 
 		 405 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  42.33 
 
 		 406 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  42.75 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  39.48 
 
 		 424 aa  276  6e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  44.47 
 
 		 405 aa  276  7e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  40.24 
 
 		 420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  40.24 
 
 		 420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  40.98 
 
 		 410 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  39.32 
 
 		 420 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  40.79 
 
 		 414 aa  264  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  42.13 
 
 		 406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  36.32 
 
 		 419 aa  250  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  36.87 
 
 		 411 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  39.33 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  36.07 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  36.57 
 
 		 613 aa  214  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  36.25 
 
 		 426 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  36.91 
 
 		 425 aa  213  7e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  36.88 
 
 		 399 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  36.45 
 
 		 399 aa  206  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  34.49 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  35.85 
 
 		 408 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  33 
 
 		 407 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  34.1 
 
 		 407 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  34.7 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  33.9 
 
 		 438 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  31.02 
 
 		 447 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  31.5 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  33.17 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  33.89 
 
 		 440 aa  193  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  33.09 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  34.54 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  32.98 
 
 		 411 aa  189  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  35.58 
 
 		 427 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  34.95 
 
 		 409 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  34.55 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  35.9 
 
 		 401 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  32.68 
 
 		 430 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  33.1 
 
 		 454 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  33.16 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  33.42 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  35.75 
 
 		 401 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  31.81 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  36.5 
 
 		 404 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  36.25 
 
 		 393 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  35.06 
 
 		 431 aa  176  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  35.52 
 
 		 453 aa  176  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  32.2 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  36.36 
 
 		 396 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  32.93 
 
 		 431 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  35.98 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  35.98 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  32.89 
 
 		 395 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  34.92 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  34.79 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  34.79 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  35.48 
 
 		 398 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  32.65 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  34.89 
 
 		 401 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  32.29 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  35.26 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  31.87 
 
 		 422 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  35.83 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  34.88 
 
 		 391 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  32.8 
 
 		 430 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  33.76 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5920  Beta-lactamase  34.78 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  36.49 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  30.45 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  31.39 
 
 		 437 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  32.91 
 
 		 397 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2474  putative esterase  35.52 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.506613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0639  putative esterase  35.52 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.74574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0340  esterase, putative  35.52 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0087  putative esterase  35.52 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  34.56 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1043  beta-lactamase  35.81 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0881  putative esterase  35.81 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0884  putative esterase  35.81 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23469  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  33.33 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  34.32 
 
 		 389 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2741  Beta-lactamase  32.29 
 
 		 396 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  25.74 
 
 		 382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  32.58 
 
 		 397 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  32.49 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>