More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5097 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  100 
 
 		 411 aa  833    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  68.7 
 
 		 407 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  67.94 
 
 		 407 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  66.67 
 
 		 407 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  66.33 
 
 		 409 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  50.77 
 
 		 402 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  45.06 
 
 		 440 aa  361  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  47.51 
 
 		 407 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  46.4 
 
 		 453 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  43.7 
 
 		 415 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  39.09 
 
 		 435 aa  299  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  43.34 
 
 		 414 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  40.45 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  41.54 
 
 		 414 aa  280  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  40.2 
 
 		 422 aa  279  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  40.61 
 
 		 422 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  40.4 
 
 		 405 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  42.82 
 
 		 444 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  40.15 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  41.96 
 
 		 420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  38.11 
 
 		 411 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  41.16 
 
 		 420 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  40.7 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  39.1 
 
 		 411 aa  270  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  40.4 
 
 		 405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  41.43 
 
 		 440 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  38.15 
 
 		 423 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  40.69 
 
 		 408 aa  265  8e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  40.62 
 
 		 430 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  41.06 
 
 		 417 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  37.16 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  40.24 
 
 		 420 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  40.24 
 
 		 420 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  40.2 
 
 		 418 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  37.25 
 
 		 430 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  41.03 
 
 		 438 aa  259  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  38.55 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  39.62 
 
 		 424 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  37.04 
 
 		 424 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  36.41 
 
 		 426 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  41.01 
 
 		 436 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  38.98 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  39.1 
 
 		 414 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  36.75 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  37.62 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  37.8 
 
 		 419 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  40.59 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  37.01 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  40.95 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  41.27 
 
 		 437 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  35.61 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  38.77 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  36.43 
 
 		 447 aa  237  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  38.14 
 
 		 420 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  37.47 
 
 		 427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  37.62 
 
 		 408 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  36.76 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  37 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  37.65 
 
 		 417 aa  226  8e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  37 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  35.71 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  32.74 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  38.16 
 
 		 613 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  37.15 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  37.15 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  37.15 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  36.54 
 
 		 406 aa  206  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  34.78 
 
 		 401 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  35.25 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  31.96 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  35.07 
 
 		 401 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  32.51 
 
 		 438 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  35.83 
 
 		 401 aa  193  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  33.16 
 
 		 438 aa  193  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  32.98 
 
 		 412 aa  189  8e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  33.67 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  32.62 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  31.2 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  33.42 
 
 		 409 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  32.69 
 
 		 468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  35.39 
 
 		 394 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  31.22 
 
 		 422 aa  182  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  30.94 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  32.9 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  31.87 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  29.56 
 
 		 395 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  29.53 
 
 		 437 aa  166  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  35.33 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  33.43 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  32.53 
 
 		 409 aa  159  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  33.23 
 
 		 377 aa  156  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  31.73 
 
 		 419 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  27.46 
 
 		 432 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3473  beta-lactamase  32.22 
 
 		 392 aa  152  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl216  putative beta-lactamase  26.83 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0394  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  32.79 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  30.42 
 
 		 398 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  32.02 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  32.02 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  32.93 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>