More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2613 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  100 
 
 
398 aa  772    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  97.98 
 
 
398 aa  752    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  97.98 
 
 
398 aa  752    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  90.13 
 
 
398 aa  670    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  82.86 
 
 
396 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5920  Beta-lactamase  85.46 
 
 
398 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0087  putative esterase  73.04 
 
 
398 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0639  putative esterase  73.04 
 
 
398 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.74574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0340  esterase, putative  73.04 
 
 
398 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2474  putative esterase  73.04 
 
 
398 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.506613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1043  beta-lactamase  72.77 
 
 
398 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0884  putative esterase  72.77 
 
 
398 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23469  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0881  putative esterase  72.77 
 
 
398 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  67.72 
 
 
393 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  67.02 
 
 
404 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  64.45 
 
 
393 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  61.13 
 
 
396 aa  463  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  62.7 
 
 
391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  60.95 
 
 
397 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  60.05 
 
 
397 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1817  beta-lactamase  60.7 
 
 
397 aa  428  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3034  beta-lactamase  63.54 
 
 
413 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396527  normal  0.941046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0402  beta-lactamase  57.66 
 
 
392 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00394756  normal  0.302831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  53.23 
 
 
409 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  53.87 
 
 
389 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6825  beta-lactamase  57.14 
 
 
382 aa  363  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  52.84 
 
 
389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1860  putative esterase  54.59 
 
 
399 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1775  putative esterase  54.32 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0329  beta-lactamase  54.32 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.021088  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1365  putative esterase  54.05 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99407  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0970  putative esterase  54.05 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.216646  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0233  putative esterase  54.05 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0408  putative esterase  54.05 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1108  beta-lactamase  54.28 
 
 
396 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2275  beta-lactamase  47.93 
 
 
383 aa  320  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0956783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2956  esterase  44.35 
 
 
384 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0198492  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2661  beta-lactamase  46.96 
 
 
377 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220174  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2741  Beta-lactamase  44.89 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2923  beta-lactamase  45.62 
 
 
394 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4084  esterase (beta-lactamase family)  40.29 
 
 
410 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  32.35 
 
 
445 aa  183  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  33.86 
 
 
424 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  37.32 
 
 
417 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  38.02 
 
 
407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2945  esterase EstB  62.32 
 
 
206 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  33.42 
 
 
414 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  34.85 
 
 
402 aa  170  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  32.37 
 
 
420 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  34.73 
 
 
414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  35.48 
 
 
412 aa  167  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  28.95 
 
 
447 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  31 
 
 
440 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  36.24 
 
 
399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  31.77 
 
 
408 aa  166  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  31.59 
 
 
424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  34.73 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  31.37 
 
 
433 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  35.95 
 
 
407 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  32.73 
 
 
417 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  28.8 
 
 
419 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  35.07 
 
 
399 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  32.51 
 
 
370 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  31.54 
 
 
422 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  32.01 
 
 
424 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  32.16 
 
 
407 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  31.14 
 
 
407 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  31.07 
 
 
420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  31.69 
 
 
418 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  34.24 
 
 
414 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  33.25 
 
 
420 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  33.25 
 
 
420 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  33.5 
 
 
426 aa  152  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  31.63 
 
 
420 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  31.9 
 
 
409 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  30.43 
 
 
400 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  33.94 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  32.48 
 
 
424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  32.28 
 
 
411 aa  147  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  30.15 
 
 
407 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  32.55 
 
 
425 aa  146  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  32.9 
 
 
453 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  31.36 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  32.28 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  30.66 
 
 
444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  30.65 
 
 
426 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  32.54 
 
 
405 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  29.7 
 
 
427 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  33.33 
 
 
440 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  31.92 
 
 
438 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  30.05 
 
 
431 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  32.81 
 
 
418 aa  136  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  27.94 
 
 
431 aa  135  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  33.17 
 
 
436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  30.67 
 
 
430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  32.24 
 
 
405 aa  133  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  31.23 
 
 
410 aa  133  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  29.57 
 
 
454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  31.55 
 
 
401 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  33.15 
 
 
613 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>