117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2945 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2945  esterase EstB  100 
 
 
206 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  73.3 
 
 
391 aa  272  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  66.44 
 
 
396 aa  192  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  66.43 
 
 
397 aa  187  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  64.58 
 
 
397 aa  185  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3034  beta-lactamase  69.86 
 
 
413 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396527  normal  0.941046 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0340  esterase, putative  64.03 
 
 
398 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0639  putative esterase  64.03 
 
 
398 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.74574  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2474  putative esterase  64.03 
 
 
398 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.506613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0087  putative esterase  64.03 
 
 
398 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1043  beta-lactamase  64.03 
 
 
398 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0881  putative esterase  64.03 
 
 
398 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0884  putative esterase  64.03 
 
 
398 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23469  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1817  beta-lactamase  63.7 
 
 
397 aa  174  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  62.32 
 
 
398 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  61.59 
 
 
398 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  61.59 
 
 
398 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  59.86 
 
 
393 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  59.15 
 
 
404 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  62.32 
 
 
396 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  47.39 
 
 
393 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6825  beta-lactamase  58.27 
 
 
382 aa  161  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  52.17 
 
 
409 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  60.87 
 
 
398 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5920  Beta-lactamase  56.52 
 
 
398 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0402  beta-lactamase  55.32 
 
 
392 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00394756  normal  0.302831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  51.68 
 
 
389 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  52.59 
 
 
389 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0970  putative esterase  53.28 
 
 
399 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.216646  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0329  beta-lactamase  53.28 
 
 
399 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.021088  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0408  putative esterase  53.28 
 
 
399 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0233  putative esterase  53.28 
 
 
399 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1860  putative esterase  53.28 
 
 
399 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1775  putative esterase  53.28 
 
 
399 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1365  putative esterase  53.28 
 
 
404 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99407  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1108  beta-lactamase  52.55 
 
 
396 aa  121  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2275  beta-lactamase  52.59 
 
 
383 aa  121  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0956783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2956  esterase  41.84 
 
 
384 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0198492  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2923  beta-lactamase  38.97 
 
 
394 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2741  Beta-lactamase  42.86 
 
 
396 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4084  esterase (beta-lactamase family)  39.16 
 
 
410 aa  93.2  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2661  beta-lactamase  41.67 
 
 
377 aa  78.2  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220174  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  35.21 
 
 
414 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  32.12 
 
 
424 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  32.14 
 
 
424 aa  68.6  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  36.42 
 
 
405 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  36.36 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  36.42 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  35.22 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  40.34 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  29.79 
 
 
438 aa  65.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  33.33 
 
 
418 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  36 
 
 
406 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  35.25 
 
 
402 aa  62.8  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  31.43 
 
 
420 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  30.77 
 
 
370 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  31.3 
 
 
438 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  31.69 
 
 
422 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  32.35 
 
 
420 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  29.79 
 
 
445 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  32.35 
 
 
420 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  34.52 
 
 
415 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  31.2 
 
 
424 aa  58.2  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  29.13 
 
 
427 aa  58.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  28.48 
 
 
420 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  30.94 
 
 
407 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  33.33 
 
 
433 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  30.92 
 
 
401 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  35.97 
 
 
405 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  37.17 
 
 
399 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  33.61 
 
 
401 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  33.61 
 
 
401 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  29.69 
 
 
411 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  29.58 
 
 
417 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  32.17 
 
 
414 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  28.57 
 
 
408 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  33.6 
 
 
420 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  31.88 
 
 
411 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  29.1 
 
 
411 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  28.18 
 
 
407 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  30 
 
 
407 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  32.45 
 
 
408 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  31.82 
 
 
424 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  29.2 
 
 
422 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  32.76 
 
 
438 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  35.82 
 
 
399 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  36.36 
 
 
423 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  31.54 
 
 
427 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1611  beta-lactamase  32.03 
 
 
411 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  45.45 
 
 
400 aa  52.4  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  31.48 
 
 
348 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  30.22 
 
 
407 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  28.75 
 
 
401 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  32.76 
 
 
412 aa  50.1  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  32.28 
 
 
426 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  32.52 
 
 
440 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  28.76 
 
 
401 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  29.05 
 
 
409 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  27.34 
 
 
419 aa  48.9  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  29.8 
 
 
401 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>