More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4911 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  100 
 
 
405 aa  813    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  93.83 
 
 
405 aa  772    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  93.33 
 
 
405 aa  771    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  71.89 
 
 
406 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  73.8 
 
 
414 aa  587  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  70.07 
 
 
407 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  54.62 
 
 
417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  53.79 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  50.85 
 
 
424 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  52.26 
 
 
420 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  50.75 
 
 
445 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  51.26 
 
 
422 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  50.12 
 
 
424 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  49.5 
 
 
408 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  50.87 
 
 
418 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  49.27 
 
 
424 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  49.13 
 
 
420 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  49.13 
 
 
420 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  50.14 
 
 
370 aa  362  6e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  48.88 
 
 
420 aa  362  9e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  46.49 
 
 
417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  47.24 
 
 
414 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  40.35 
 
 
419 aa  319  7e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  46.55 
 
 
410 aa  316  5e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  45.71 
 
 
400 aa  310  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  42.61 
 
 
438 aa  295  7e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  44.47 
 
 
412 aa  288  1e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  43.92 
 
 
406 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  40.05 
 
 
411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  39.95 
 
 
424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  39.47 
 
 
411 aa  279  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  39.01 
 
 
407 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  39.46 
 
 
440 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  41.15 
 
 
411 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  42.68 
 
 
402 aa  276  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  41.5 
 
 
426 aa  275  9e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  42.48 
 
 
613 aa  272  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  38.59 
 
 
447 aa  269  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  37.91 
 
 
407 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  38.67 
 
 
407 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  39.18 
 
 
454 aa  264  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  40.05 
 
 
399 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  37.65 
 
 
433 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  39.66 
 
 
407 aa  255  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  40.33 
 
 
415 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  39.66 
 
 
409 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  36.86 
 
 
408 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  40.57 
 
 
453 aa  249  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  40.8 
 
 
399 aa  249  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  38.35 
 
 
418 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  37.25 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  37.12 
 
 
430 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  35.4 
 
 
435 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  37.26 
 
 
452 aa  239  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  36.7 
 
 
423 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  35.63 
 
 
426 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  33.09 
 
 
427 aa  229  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  38.66 
 
 
427 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  35.15 
 
 
425 aa  225  8e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  39.85 
 
 
414 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  33.25 
 
 
382 aa  219  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  38.5 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  38.5 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  38.5 
 
 
401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  37.59 
 
 
438 aa  213  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  36.34 
 
 
468 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  37.63 
 
 
401 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  35.61 
 
 
444 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  35.14 
 
 
422 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  34.79 
 
 
438 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  37.73 
 
 
401 aa  207  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  35.62 
 
 
430 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  36.63 
 
 
409 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  37.37 
 
 
401 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  36.34 
 
 
440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  36.17 
 
 
436 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  35.22 
 
 
437 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  35.01 
 
 
422 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  33.16 
 
 
395 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  33.42 
 
 
395 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  35.48 
 
 
428 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  33.5 
 
 
431 aa  189  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  32.45 
 
 
395 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  32.63 
 
 
395 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  33.97 
 
 
416 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  36.13 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  34.42 
 
 
419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  34.33 
 
 
395 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  33.88 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  27.71 
 
 
432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  36.32 
 
 
391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  29.69 
 
 
377 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  30.69 
 
 
431 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  32.66 
 
 
397 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1072  beta-lactamase  33.94 
 
 
410 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22387  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  31.93 
 
 
409 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3473  beta-lactamase  32.72 
 
 
392 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  33.51 
 
 
393 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  29.1 
 
 
437 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  31.95 
 
 
396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>