More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3069 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  100 
 
 
400 aa  815    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  62.03 
 
 
406 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  54.61 
 
 
408 aa  435  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  56.28 
 
 
410 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  52.63 
 
 
422 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  51.95 
 
 
424 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  53.13 
 
 
420 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  53.94 
 
 
417 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  53.38 
 
 
420 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  51.46 
 
 
424 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  51.82 
 
 
424 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  50.61 
 
 
418 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  51.72 
 
 
420 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  50.86 
 
 
420 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  50.86 
 
 
420 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  48 
 
 
414 aa  359  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  48.12 
 
 
370 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  46.37 
 
 
414 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  45.11 
 
 
406 aa  336  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  46.02 
 
 
445 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  45.14 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  45.71 
 
 
405 aa  316  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  45.45 
 
 
405 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  45.71 
 
 
405 aa  310  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  44.12 
 
 
417 aa  302  8.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  42.75 
 
 
412 aa  293  4e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  41.71 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  41.88 
 
 
407 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  40.49 
 
 
407 aa  269  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  40.95 
 
 
407 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  36.75 
 
 
419 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  38.61 
 
 
423 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  38.37 
 
 
438 aa  256  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  40.95 
 
 
411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  38.39 
 
 
440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  42.34 
 
 
453 aa  249  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  38.44 
 
 
399 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  39.85 
 
 
402 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  38.52 
 
 
411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  37.56 
 
 
399 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  37.62 
 
 
426 aa  239  5.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  37.35 
 
 
411 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  38 
 
 
409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  35.61 
 
 
424 aa  233  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  37.44 
 
 
430 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  36.83 
 
 
415 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  36.95 
 
 
431 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  39.84 
 
 
613 aa  229  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  39.81 
 
 
418 aa  229  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  37.94 
 
 
414 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  35.84 
 
 
447 aa  229  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  36.29 
 
 
427 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  35.98 
 
 
426 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  36.05 
 
 
433 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  34.5 
 
 
408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  34.15 
 
 
454 aa  219  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  36.53 
 
 
452 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  39.39 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  37.53 
 
 
401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  33.08 
 
 
435 aa  212  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  35.5 
 
 
422 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  36.84 
 
 
401 aa  210  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  36.16 
 
 
401 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  36.16 
 
 
401 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  36.26 
 
 
401 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  35.6 
 
 
401 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  36.97 
 
 
430 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  32.01 
 
 
427 aa  199  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  31.68 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  36.04 
 
 
425 aa  196  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  36.07 
 
 
436 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  33.82 
 
 
468 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  32.84 
 
 
444 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  34.46 
 
 
409 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  34.26 
 
 
431 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  32.6 
 
 
409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  35.56 
 
 
397 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  35.42 
 
 
389 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  32.37 
 
 
416 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  31.01 
 
 
438 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  32.72 
 
 
391 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  35.47 
 
 
437 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  33.51 
 
 
389 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  31.27 
 
 
395 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  31.63 
 
 
394 aa  166  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  30.41 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  30.21 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  33.96 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  33.06 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  32.48 
 
 
398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  32.48 
 
 
398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  33.88 
 
 
389 aa  163  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  33.5 
 
 
393 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  31.46 
 
 
398 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  31.59 
 
 
395 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  34.99 
 
 
428 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  32.8 
 
 
396 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  33.25 
 
 
404 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  29.59 
 
 
377 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  32.91 
 
 
393 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>