More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2694 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  100 
 
 
453 aa  895    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  50.36 
 
 
402 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  46.94 
 
 
407 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  46.08 
 
 
407 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  46.4 
 
 
411 aa  335  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  43.27 
 
 
440 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  45.3 
 
 
409 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  43.38 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  44.42 
 
 
423 aa  325  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  41.87 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  43.17 
 
 
415 aa  308  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  42.65 
 
 
414 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  41.56 
 
 
407 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  39.47 
 
 
445 aa  286  4e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  41.12 
 
 
422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  41.89 
 
 
406 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  43.96 
 
 
414 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  42.22 
 
 
418 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  44.17 
 
 
440 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  39.49 
 
 
411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  40.81 
 
 
405 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  40.81 
 
 
405 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  40.71 
 
 
408 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  41.83 
 
 
407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  41.59 
 
 
420 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  41.59 
 
 
420 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  37.62 
 
 
411 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  35.78 
 
 
419 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  38.75 
 
 
430 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  42.93 
 
 
430 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  39.42 
 
 
438 aa  262  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  39.85 
 
 
408 aa  262  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  40.71 
 
 
420 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  38.03 
 
 
454 aa  260  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  37.58 
 
 
433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  38.74 
 
 
426 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  40.95 
 
 
414 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  35.1 
 
 
447 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  39.72 
 
 
418 aa  256  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  39.76 
 
 
420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  38.16 
 
 
424 aa  252  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  40.57 
 
 
405 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  39.1 
 
 
436 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  38.82 
 
 
420 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  38.3 
 
 
424 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  38.36 
 
 
424 aa  250  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  38.58 
 
 
370 aa  250  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  37.77 
 
 
431 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  40.55 
 
 
422 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  38.2 
 
 
426 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  42.34 
 
 
400 aa  246  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  39.53 
 
 
424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  37.5 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  40.76 
 
 
417 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  39.95 
 
 
417 aa  242  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  39.53 
 
 
410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  39.14 
 
 
437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  38.36 
 
 
613 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  36.12 
 
 
452 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  36.52 
 
 
399 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  34.69 
 
 
438 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  35.78 
 
 
399 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  36.02 
 
 
427 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  32.11 
 
 
382 aa  210  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  35.91 
 
 
438 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  37.35 
 
 
406 aa  206  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  37.79 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  38.98 
 
 
401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  36.39 
 
 
401 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  36.39 
 
 
401 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  36.39 
 
 
401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  32.38 
 
 
427 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  34.9 
 
 
422 aa  193  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  37.38 
 
 
431 aa  193  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  36.18 
 
 
409 aa  192  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  36 
 
 
401 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  33.94 
 
 
395 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  35.52 
 
 
412 aa  187  4e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  32.78 
 
 
468 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  33.42 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  34.14 
 
 
425 aa  184  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  33.69 
 
 
395 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  31.43 
 
 
431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  31.52 
 
 
377 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  32.3 
 
 
409 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  34.78 
 
 
397 aa  177  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  33.42 
 
 
401 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3473  beta-lactamase  37.65 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2741  Beta-lactamase  33.5 
 
 
396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  34.86 
 
 
398 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  31.92 
 
 
416 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  32.33 
 
 
419 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1072  beta-lactamase  34.42 
 
 
410 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22387  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  36.11 
 
 
389 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2956  esterase  33.33 
 
 
384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0198492  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  31.22 
 
 
395 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  35.14 
 
 
396 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  33.85 
 
 
393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  33.25 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  33.51 
 
 
397 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>