More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5281 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  100 
 
 
408 aa  826    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  46.25 
 
 
438 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  44.63 
 
 
454 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  38.8 
 
 
419 aa  279  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  39.36 
 
 
414 aa  276  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  39.17 
 
 
406 aa  276  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  37.96 
 
 
452 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  38.29 
 
 
407 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  38.05 
 
 
420 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  38.89 
 
 
411 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  37.72 
 
 
405 aa  257  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  38.05 
 
 
420 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  37.72 
 
 
405 aa  255  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  38.85 
 
 
414 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  40.53 
 
 
402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  35.38 
 
 
445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  39.85 
 
 
453 aa  253  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  36.92 
 
 
411 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  38.56 
 
 
370 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  36.16 
 
 
422 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  37.02 
 
 
424 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  36.86 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  35.49 
 
 
424 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  36.78 
 
 
417 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  37.73 
 
 
407 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  35.48 
 
 
424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  35.14 
 
 
440 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  34.57 
 
 
408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  35.7 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  37.95 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  35.84 
 
 
418 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  37.62 
 
 
411 aa  233  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  40.11 
 
 
401 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  36.75 
 
 
417 aa  233  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  40.11 
 
 
401 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  40.11 
 
 
401 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  36.95 
 
 
407 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  36.93 
 
 
613 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  35.11 
 
 
420 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  37.84 
 
 
426 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  36.07 
 
 
447 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  35.59 
 
 
424 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  35.82 
 
 
423 aa  226  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  38.48 
 
 
409 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  35.56 
 
 
420 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  35.56 
 
 
420 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  35.57 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  36.95 
 
 
422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  38.79 
 
 
430 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  39.53 
 
 
401 aa  219  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  37.28 
 
 
438 aa  219  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  35.34 
 
 
410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  38.16 
 
 
414 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  36.43 
 
 
438 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  36.25 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  39.69 
 
 
427 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  37.98 
 
 
401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  39.52 
 
 
401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  34.89 
 
 
426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  32.01 
 
 
382 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  38.38 
 
 
440 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  33.42 
 
 
435 aa  209  7e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  34.74 
 
 
430 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  34.5 
 
 
400 aa  209  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  35.68 
 
 
418 aa  205  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  33.16 
 
 
395 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  35.85 
 
 
444 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  35.85 
 
 
412 aa  201  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  32.4 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  36.6 
 
 
437 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  33.09 
 
 
431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  36.1 
 
 
409 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  35.73 
 
 
399 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  31.13 
 
 
395 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  33.09 
 
 
399 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  33.5 
 
 
427 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  33.99 
 
 
406 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  30.42 
 
 
395 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  36.53 
 
 
436 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  35.57 
 
 
468 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  38.85 
 
 
394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  32.91 
 
 
431 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  35.28 
 
 
428 aa  180  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  34.49 
 
 
416 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  32.72 
 
 
419 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  31.84 
 
 
437 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  38.34 
 
 
431 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  30.55 
 
 
432 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  33.51 
 
 
395 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  32.52 
 
 
397 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3549  beta-lactamase  30.42 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  33.85 
 
 
425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1611  beta-lactamase  33.91 
 
 
411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  31.68 
 
 
422 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  34 
 
 
389 aa  163  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  32.8 
 
 
389 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  32.98 
 
 
409 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  32.98 
 
 
391 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2104  beta-lactamase  30.1 
 
 
396 aa  155  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0089  beta-lactamase  30.03 
 
 
401 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>