More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3750 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  87.41 
 
 		 397 aa  695    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  100 
 
 		 397 aa  803    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  77.92 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1817  beta-lactamase  76.15 
 
 		 397 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3034  beta-lactamase  74.08 
 
 		 413 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396527  normal  0.941046 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  65.6 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  65.05 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  63.45 
 
 		 391 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  60.8 
 
 		 393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  61.48 
 
 		 398 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  61.48 
 
 		 398 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  61.29 
 
 		 396 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  60.95 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0340  esterase, putative  64.19 
 
 		 398 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0881  putative esterase  64.19 
 
 		 398 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1043  beta-lactamase  64.19 
 
 		 398 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0639  putative esterase  64.19 
 
 		 398 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.74574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0087  putative esterase  64.19 
 
 		 398 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0884  putative esterase  64.19 
 
 		 398 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23469  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2474  putative esterase  64.19 
 
 		 398 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.506613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  59.89 
 
 		 398 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5920  Beta-lactamase  59.37 
 
 		 398 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0402  beta-lactamase  53.51 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00394756  normal  0.302831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  51.88 
 
 		 409 aa  381  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6825  beta-lactamase  57.26 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  52.05 
 
 		 389 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  51.19 
 
 		 389 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1860  putative esterase  53.93 
 
 		 399 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1775  putative esterase  53.39 
 
 		 399 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0329  beta-lactamase  53.39 
 
 		 399 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.021088  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0233  putative esterase  53.39 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1365  putative esterase  53.39 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99407  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0970  putative esterase  53.39 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.216646  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0408  putative esterase  53.39 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1108  beta-lactamase  54.3 
 
 		 396 aa  340  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2275  beta-lactamase  47.86 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0956783 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2661  beta-lactamase  48.34 
 
 		 377 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220174  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2956  esterase  44.09 
 
 		 384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0198492  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2923  beta-lactamase  42.09 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2741  Beta-lactamase  44.21 
 
 		 396 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4084  esterase (beta-lactamase family)  36.67 
 
 		 410 aa  239  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2945  esterase EstB  66.43 
 
 		 206 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  31.54 
 
 		 447 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  31.45 
 
 		 445 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  30.71 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  35.07 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  37.4 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  33.42 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  33.07 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  35.09 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  32.63 
 
 		 424 aa  173  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  34.26 
 
 		 417 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  30.03 
 
 		 433 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  33.25 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  35 
 
 		 407 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  33.75 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  35.84 
 
 		 399 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  32.51 
 
 		 423 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  32.84 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  33.96 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  32.73 
 
 		 408 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  32.82 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  32.41 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  33.33 
 
 		 407 aa  159  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  33.93 
 
 		 414 aa  156  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  35 
 
 		 401 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  35 
 
 		 401 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  35 
 
 		 401 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  32.91 
 
 		 412 aa  155  8e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  33.25 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  32.82 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  34.57 
 
 		 453 aa  154  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  33.77 
 
 		 405 aa  153  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  31.91 
 
 		 409 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  34.04 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  32.63 
 
 		 420 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  32.63 
 
 		 420 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  32.12 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  29.5 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  29.9 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  30.89 
 
 		 424 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  30.93 
 
 		 420 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  32.08 
 
 		 424 aa  145  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  29.47 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  29.75 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  31.68 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  28.25 
 
 		 427 aa  143  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  31.9 
 
 		 613 aa  142  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  33.51 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  32.9 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  29.55 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  29.59 
 
 		 454 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  30.84 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  32.7 
 
 		 401 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  30.25 
 
 		 452 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  29.21 
 
 		 411 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  32.11 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  30.83 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  29.82 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  27.37 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>