More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2408 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  99 
 
 
401 aa  807    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  100 
 
 
401 aa  815    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  100 
 
 
401 aa  815    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  75.06 
 
 
401 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  72.68 
 
 
401 aa  595  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  70.32 
 
 
401 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  46.98 
 
 
427 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  48.46 
 
 
399 aa  315  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  48.74 
 
 
399 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  40.55 
 
 
438 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  42.5 
 
 
394 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  38.69 
 
 
420 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  37.33 
 
 
419 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  37.87 
 
 
420 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  40.11 
 
 
408 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  38.44 
 
 
445 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  39.61 
 
 
370 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  37.4 
 
 
422 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  37.83 
 
 
424 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  37.87 
 
 
417 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  39.62 
 
 
420 aa  225  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  39.62 
 
 
420 aa  225  9e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  36.89 
 
 
414 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  38.26 
 
 
405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  38.21 
 
 
613 aa  223  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  38.93 
 
 
405 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  38.92 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  35.66 
 
 
424 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  40.71 
 
 
406 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  36.89 
 
 
452 aa  219  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  36.39 
 
 
407 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  40.44 
 
 
414 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  37.53 
 
 
418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  38.77 
 
 
417 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  36.67 
 
 
407 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  35.28 
 
 
407 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  39.4 
 
 
468 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  34.92 
 
 
424 aa  211  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  40.54 
 
 
409 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  34.7 
 
 
408 aa  209  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  37.15 
 
 
411 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  38.67 
 
 
405 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  37 
 
 
426 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  37.3 
 
 
420 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  36.78 
 
 
407 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  32.38 
 
 
411 aa  202  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  36.26 
 
 
409 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  34.81 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  37.74 
 
 
407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  39.14 
 
 
416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  37.3 
 
 
440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  38.38 
 
 
415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  38.59 
 
 
414 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  32.98 
 
 
411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  34.07 
 
 
435 aa  196  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  33.42 
 
 
447 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1611  beta-lactamase  38.08 
 
 
411 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  33.79 
 
 
423 aa  193  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  35.44 
 
 
430 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  36.13 
 
 
453 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  38.98 
 
 
410 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  36.16 
 
 
400 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  35.68 
 
 
440 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  35.73 
 
 
424 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  34.81 
 
 
402 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  34.03 
 
 
431 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02730  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  40.94 
 
 
375 aa  189  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104017  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  34.03 
 
 
433 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  34.78 
 
 
438 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  37.04 
 
 
436 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05480  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  35.91 
 
 
380 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  35.23 
 
 
426 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  35.97 
 
 
430 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  34.97 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  31.58 
 
 
382 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  36.57 
 
 
406 aa  176  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4066  beta-lactamase  35.98 
 
 
385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  34.17 
 
 
444 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  36.59 
 
 
437 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  34.79 
 
 
412 aa  167  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  33.33 
 
 
438 aa  166  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  31.66 
 
 
437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  30.79 
 
 
395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  31.7 
 
 
395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  31.19 
 
 
395 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  38.36 
 
 
431 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  34.64 
 
 
397 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  30.62 
 
 
425 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  35.16 
 
 
395 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  33.16 
 
 
419 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  28.53 
 
 
427 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  33.6 
 
 
428 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  35 
 
 
397 aa  156  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2230  beta-lactamase  37.09 
 
 
380 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1441  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  37.62 
 
 
395 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00263583  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  31.79 
 
 
397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  34.38 
 
 
389 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  35.48 
 
 
389 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl216  putative beta-lactamase  25.6 
 
 
372 aa  152  1e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  30.41 
 
 
395 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>