More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3034 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3034  beta-lactamase  100 
 
 
413 aa  808    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396527  normal  0.941046 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  75.46 
 
 
396 aa  565  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  72.84 
 
 
397 aa  560  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1817  beta-lactamase  75.51 
 
 
397 aa  557  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  74.08 
 
 
397 aa  557  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  67.62 
 
 
391 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  65.61 
 
 
393 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  65.17 
 
 
404 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  63.14 
 
 
398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  63.14 
 
 
398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0639  putative esterase  66.49 
 
 
398 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.74574  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2474  putative esterase  66.49 
 
 
398 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.506613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0340  esterase, putative  66.49 
 
 
398 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  62.53 
 
 
398 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0087  putative esterase  66.49 
 
 
398 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  63.49 
 
 
396 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1043  beta-lactamase  66.23 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  62.53 
 
 
393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0881  putative esterase  66.23 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0884  putative esterase  66.23 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23469  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  61.52 
 
 
398 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5920  Beta-lactamase  60.81 
 
 
398 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0402  beta-lactamase  57.8 
 
 
392 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00394756  normal  0.302831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  52 
 
 
409 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  53.2 
 
 
389 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  52.69 
 
 
389 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6825  beta-lactamase  56.8 
 
 
382 aa  359  5e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1860  putative esterase  54.42 
 
 
399 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1775  putative esterase  54.16 
 
 
399 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0329  beta-lactamase  54.16 
 
 
399 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.021088  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0970  putative esterase  53.89 
 
 
399 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.216646  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1365  putative esterase  53.89 
 
 
404 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99407  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0233  putative esterase  53.89 
 
 
399 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0408  putative esterase  53.89 
 
 
399 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1108  beta-lactamase  53.32 
 
 
396 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2275  beta-lactamase  48.31 
 
 
383 aa  322  8e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0956783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2956  esterase  44.8 
 
 
384 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0198492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2741  Beta-lactamase  45.31 
 
 
396 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2923  beta-lactamase  45.97 
 
 
394 aa  277  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2661  beta-lactamase  48.19 
 
 
377 aa  273  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220174  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4084  esterase (beta-lactamase family)  38.35 
 
 
410 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2945  esterase EstB  69.86 
 
 
206 aa  202  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  32.84 
 
 
445 aa  192  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  33.73 
 
 
424 aa  189  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  33.33 
 
 
424 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  35.84 
 
 
402 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  31.18 
 
 
447 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  38.48 
 
 
407 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  33.33 
 
 
424 aa  186  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  34.02 
 
 
417 aa  186  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  32.69 
 
 
408 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  34.08 
 
 
414 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  35.38 
 
 
414 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  38.56 
 
 
399 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  31.62 
 
 
420 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  33 
 
 
417 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  32.83 
 
 
420 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  34.9 
 
 
370 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  34.9 
 
 
406 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  32.99 
 
 
424 aa  176  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  32.66 
 
 
422 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  29.44 
 
 
419 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  30.31 
 
 
433 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  33.33 
 
 
407 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  37.28 
 
 
399 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  35.22 
 
 
414 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  31.13 
 
 
440 aa  166  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  32.84 
 
 
423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  32.04 
 
 
400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  28.97 
 
 
427 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  31.49 
 
 
420 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  35.71 
 
 
453 aa  163  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  32.2 
 
 
418 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  33.42 
 
 
405 aa  162  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  33.42 
 
 
405 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  32.65 
 
 
401 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  32.28 
 
 
426 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  35.99 
 
 
401 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  33.42 
 
 
408 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  32.39 
 
 
401 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  35.73 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  35.73 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  32.55 
 
 
418 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  31.93 
 
 
422 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  33.59 
 
 
412 aa  152  7e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  33.7 
 
 
405 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  32.04 
 
 
420 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  32.04 
 
 
420 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  30.17 
 
 
409 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  30.08 
 
 
435 aa  151  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  31.27 
 
 
395 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  29.43 
 
 
407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  33.69 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  31.66 
 
 
613 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  32.43 
 
 
427 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  30.65 
 
 
411 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  29.43 
 
 
407 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  29.9 
 
 
395 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  30.05 
 
 
430 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  29.74 
 
 
431 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>