More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0402 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0402  beta-lactamase  100 
 
 
392 aa  768    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00394756  normal  0.302831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  56.61 
 
 
393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  55.82 
 
 
404 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  56.1 
 
 
396 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1817  beta-lactamase  55.15 
 
 
397 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  54.23 
 
 
397 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  53.51 
 
 
397 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  57.94 
 
 
398 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  57.94 
 
 
398 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  57.66 
 
 
398 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  54.21 
 
 
393 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  56.11 
 
 
396 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3034  beta-lactamase  57.8 
 
 
413 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396527  normal  0.941046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  56.99 
 
 
391 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  56.27 
 
 
398 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5920  Beta-lactamase  54.04 
 
 
398 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0884  putative esterase  55.34 
 
 
398 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23469  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0881  putative esterase  55.34 
 
 
398 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1043  beta-lactamase  55.34 
 
 
398 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0639  putative esterase  55.34 
 
 
398 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.74574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0340  esterase, putative  55.34 
 
 
398 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0087  putative esterase  55.34 
 
 
398 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490998  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2474  putative esterase  55.34 
 
 
398 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.506613  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  48.33 
 
 
409 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6825  beta-lactamase  54.27 
 
 
382 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1860  putative esterase  50.14 
 
 
399 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2275  beta-lactamase  49.07 
 
 
383 aa  313  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0956783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  47.84 
 
 
389 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0329  beta-lactamase  49.58 
 
 
399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.021088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1775  putative esterase  49.58 
 
 
399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0233  putative esterase  49.58 
 
 
399 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0970  putative esterase  49.58 
 
 
399 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.216646  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0408  putative esterase  49.58 
 
 
399 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1365  putative esterase  49.58 
 
 
404 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99407  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  48.48 
 
 
389 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1108  beta-lactamase  48.62 
 
 
396 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2956  esterase  44.02 
 
 
384 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0198492  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2661  beta-lactamase  44.57 
 
 
377 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220174  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2741  Beta-lactamase  43.13 
 
 
396 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2923  beta-lactamase  41.64 
 
 
394 aa  237  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4084  esterase (beta-lactamase family)  34.8 
 
 
410 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  32.55 
 
 
424 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  31.79 
 
 
402 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  30.96 
 
 
407 aa  153  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  31.09 
 
 
370 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  28.68 
 
 
433 aa  149  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  31.94 
 
 
453 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  28.77 
 
 
440 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  32.51 
 
 
399 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  29.37 
 
 
400 aa  144  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  31.32 
 
 
414 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  28.29 
 
 
445 aa  143  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2945  esterase EstB  55.32 
 
 
206 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  31.76 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  32.69 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  27.12 
 
 
419 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  26.01 
 
 
447 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  27.84 
 
 
407 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  29.46 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  30.75 
 
 
406 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  28.23 
 
 
407 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  27.51 
 
 
408 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  29.66 
 
 
420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  28.46 
 
 
424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  33.08 
 
 
412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  27.97 
 
 
407 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  32.96 
 
 
407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  28.87 
 
 
409 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  28.83 
 
 
438 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  29.75 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  29.77 
 
 
426 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  31.23 
 
 
414 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  31.32 
 
 
408 aa  126  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4066  beta-lactamase  31.48 
 
 
385 aa  126  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  28.35 
 
 
422 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl600  putative beta-lactamase  22.4 
 
 
369 aa  125  2e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  28.06 
 
 
411 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  29.92 
 
 
422 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  28.03 
 
 
414 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  28.9 
 
 
417 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  29.04 
 
 
418 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  30.64 
 
 
454 aa  122  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  28.93 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  30.93 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  26.33 
 
 
427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  29.32 
 
 
452 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  30.67 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  28.88 
 
 
435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  31.27 
 
 
405 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2230  beta-lactamase  34.34 
 
 
380 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  31.17 
 
 
401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  31.14 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  26.57 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  26.88 
 
 
426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  26.58 
 
 
438 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  27.42 
 
 
431 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  28.38 
 
 
420 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  28.38 
 
 
420 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  29.63 
 
 
613 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  29.09 
 
 
409 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>