More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0297 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  100 
 
 
417 aa  840    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  46.81 
 
 
445 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  49.28 
 
 
406 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  48.9 
 
 
414 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  46.99 
 
 
405 aa  342  8e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  46.99 
 
 
405 aa  341  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  45.93 
 
 
424 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  44.55 
 
 
424 aa  338  8e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  47.61 
 
 
407 aa  338  9e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  46.81 
 
 
420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  45.34 
 
 
422 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  45.59 
 
 
420 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  46.75 
 
 
417 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  46.49 
 
 
405 aa  331  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  44.28 
 
 
408 aa  327  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  47.72 
 
 
370 aa  325  9e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  43.37 
 
 
424 aa  323  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  46.81 
 
 
418 aa  323  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  45.34 
 
 
420 aa  313  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  46.04 
 
 
420 aa  308  9e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  46.04 
 
 
420 aa  308  9e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  40.15 
 
 
419 aa  299  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  45.17 
 
 
414 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  44.12 
 
 
400 aa  295  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  46.38 
 
 
410 aa  289  7e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  43.57 
 
 
412 aa  286  4e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  40.88 
 
 
406 aa  273  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  42.23 
 
 
426 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  39.76 
 
 
438 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  42.03 
 
 
407 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  38.59 
 
 
613 aa  257  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  38.7 
 
 
447 aa  253  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  38.89 
 
 
440 aa  250  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  38.39 
 
 
424 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  37.79 
 
 
418 aa  246  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  40.29 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  37.75 
 
 
407 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  42.33 
 
 
399 aa  239  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  40.1 
 
 
402 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  38.11 
 
 
454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  36.75 
 
 
408 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  35.87 
 
 
423 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  37.47 
 
 
407 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  39.95 
 
 
453 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  36.98 
 
 
407 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  39.69 
 
 
401 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  37.65 
 
 
411 aa  226  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  41.24 
 
 
440 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  37.5 
 
 
415 aa  223  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  34.43 
 
 
433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  36.76 
 
 
425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  34.31 
 
 
411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  38.7 
 
 
401 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  35.38 
 
 
409 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  33.75 
 
 
427 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  35.21 
 
 
435 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  34.27 
 
 
411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  36.06 
 
 
426 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  38.77 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  38.93 
 
 
427 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  38.24 
 
 
414 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  38.77 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  36.87 
 
 
452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  38.87 
 
 
401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  35.01 
 
 
430 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  36.93 
 
 
401 aa  207  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  34.69 
 
 
431 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  34.92 
 
 
444 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  36.67 
 
 
430 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  34.96 
 
 
422 aa  193  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  31.09 
 
 
382 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  35.97 
 
 
393 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  33.33 
 
 
438 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  35.97 
 
 
404 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  33.16 
 
 
395 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  35.4 
 
 
468 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  37.8 
 
 
398 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  37.8 
 
 
398 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  36.92 
 
 
436 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  36.36 
 
 
393 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  33.5 
 
 
416 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  36.05 
 
 
397 aa  186  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  35.35 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  31.5 
 
 
431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  32.11 
 
 
395 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  38.12 
 
 
398 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  36.46 
 
 
391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  37.32 
 
 
398 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  35 
 
 
396 aa  179  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  32.11 
 
 
395 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  34.96 
 
 
409 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  35.45 
 
 
396 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  31.69 
 
 
395 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  37.85 
 
 
437 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  35.35 
 
 
394 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  34.91 
 
 
389 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  32.37 
 
 
438 aa  177  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  33.16 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2741  Beta-lactamase  34.1 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.197222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>