More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0454 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  100 
 
 		 409 aa  832    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  73.38 
 
 		 468 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  69.53 
 
 		 416 aa  557  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  46.21 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4066  beta-lactamase  42.42 
 
 		 385 aa  282  9e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1611  beta-lactamase  38.56 
 
 		 411 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  38.83 
 
 		 399 aa  245  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  39.31 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2230  beta-lactamase  41.16 
 
 		 380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  39.9 
 
 		 427 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  38.56 
 
 		 414 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  32.86 
 
 		 447 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  36.5 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  40.26 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  32.2 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  40.37 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  33.74 
 
 		 433 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  40.54 
 
 		 401 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  40.54 
 
 		 401 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  40.05 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  39.53 
 
 		 401 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  37.31 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  34.23 
 
 		 422 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  36.14 
 
 		 405 aa  202  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  36.14 
 
 		 405 aa  202  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  35.37 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02730  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  39.18 
 
 		 375 aa  202  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  36.18 
 
 		 407 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  33.17 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  34.97 
 
 		 420 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  36.32 
 
 		 409 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  33.41 
 
 		 424 aa  199  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  35.34 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  34.2 
 
 		 420 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  37.13 
 
 		 405 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  34.13 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  36.1 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  34.09 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  34.09 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  37.53 
 
 		 407 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  33.89 
 
 		 418 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  36.76 
 
 		 410 aa  193  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  35.56 
 
 		 414 aa  193  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  33.18 
 
 		 424 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  33.25 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05480  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.1 
 
 		 380 aa  190  4e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  33.17 
 
 		 423 aa  189  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  32.67 
 
 		 408 aa  189  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  31.65 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  33.42 
 
 		 430 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  32.78 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5065  beta-lactamase  36.76 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  35.82 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  34.44 
 
 		 454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  33.42 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  33.85 
 
 		 370 aa  183  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  31.5 
 
 		 424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  33 
 
 		 438 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  34.96 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  32.1 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  34.96 
 
 		 407 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  32.2 
 
 		 426 aa  176  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  31.67 
 
 		 440 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  30.22 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  33.85 
 
 		 613 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  31.91 
 
 		 438 aa  173  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  31.99 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  31.28 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  32.6 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  32.3 
 
 		 453 aa  169  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  29.62 
 
 		 411 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  31.75 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  30.17 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  32.06 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  32.3 
 
 		 422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  32.22 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  35.11 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  29.33 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  28.53 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  29.63 
 
 		 424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  31.68 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  31.79 
 
 		 437 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  33.33 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  30.53 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  30.69 
 
 		 414 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  31.02 
 
 		 395 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  29.68 
 
 		 444 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  31.64 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  30.46 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  27.32 
 
 		 431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  29.55 
 
 		 437 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  29.77 
 
 		 412 aa  136  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  31.59 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  26.35 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  30.75 
 
 		 395 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2104  beta-lactamase  30.21 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  28.33 
 
 		 419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  29.76 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  30.33 
 
 		 397 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  30.22 
 
 		 422 aa  126  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>