More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3562 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  100 
 
 		 394 aa  789    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  44.99 
 
 		 468 aa  316  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  46.21 
 
 		 409 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  44.23 
 
 		 416 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4066  beta-lactamase  44.22 
 
 		 385 aa  276  6e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  39.95 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1611  beta-lactamase  42.67 
 
 		 411 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  39.65 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  42.98 
 
 		 401 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  42.98 
 
 		 401 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  41.32 
 
 		 401 aa  242  9e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  41.94 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  40 
 
 		 401 aa  236  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  38.99 
 
 		 427 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  34.85 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  37.87 
 
 		 438 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  37.99 
 
 		 414 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  38.1 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  36.44 
 
 		 401 aa  199  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  36.77 
 
 		 407 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05480  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  35.39 
 
 		 380 aa  196  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2230  beta-lactamase  40.85 
 
 		 380 aa  196  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5065  beta-lactamase  38.4 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  34.82 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  35.96 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  35.1 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  37.79 
 
 		 453 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  35.75 
 
 		 407 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  33.33 
 
 		 435 aa  189  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  36.1 
 
 		 407 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  35.64 
 
 		 409 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  32.99 
 
 		 447 aa  185  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  35.32 
 
 		 418 aa  186  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  35.46 
 
 		 454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  35.56 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  38.85 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  34.55 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  34.3 
 
 		 420 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  33.57 
 
 		 424 aa  183  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  35.39 
 
 		 411 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  33.98 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  35.92 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  35.92 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  33.76 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  33.92 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  35.15 
 
 		 407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  34.94 
 
 		 402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  34.49 
 
 		 370 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  36.36 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  34.99 
 
 		 452 aa  180  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  34.02 
 
 		 411 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  35 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  34.03 
 
 		 420 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  35.35 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  35.6 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  34.92 
 
 		 613 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  35 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  33.01 
 
 		 424 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  30.94 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  31.03 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  32.43 
 
 		 430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  33.68 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  34.09 
 
 		 438 aa  173  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  31.54 
 
 		 382 aa  173  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02730  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.73 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  34.63 
 
 		 440 aa  169  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  31.46 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  32.54 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  33.33 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  32.06 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  32 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  32.59 
 
 		 408 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  34.2 
 
 		 422 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  33.6 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  33.5 
 
 		 436 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  34.3 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  31.63 
 
 		 400 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  30.65 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  32.26 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  30.71 
 
 		 415 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  30.19 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  33.7 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  30.62 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  29.57 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  31.89 
 
 		 422 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  35.87 
 
 		 431 aa  145  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  31.3 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  32.23 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  33.25 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  29.95 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  31.47 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  28.57 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  30.79 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  31.15 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  28.95 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  31.68 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  31.12 
 
 		 419 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  31.84 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  31.03 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  29.97 
 
 		 397 aa  126  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>