More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05480 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05480  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  100 
 
 		 380 aa  751    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  34.78 
 
 		 468 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  36.8 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1611  beta-lactamase  39.31 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  35.62 
 
 		 409 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  36.36 
 
 		 401 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  36.36 
 
 		 401 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  36.36 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  34.36 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  35.46 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5065  beta-lactamase  38.48 
 
 		 373 aa  193  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  36.67 
 
 		 427 aa  190  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  34.78 
 
 		 399 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4066  beta-lactamase  34.65 
 
 		 385 aa  186  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  30.98 
 
 		 419 aa  185  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  33.42 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2230  beta-lactamase  36.86 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  32.89 
 
 		 401 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  33.97 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  32.59 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  32.16 
 
 		 406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  31.47 
 
 		 414 aa  162  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  31.19 
 
 		 426 aa  159  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  31.61 
 
 		 613 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02730  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.04 
 
 		 375 aa  159  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  30.91 
 
 		 418 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  32.2 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  26.61 
 
 		 445 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  28.3 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  30.45 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  29.74 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  29.74 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  30.65 
 
 		 454 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  27.23 
 
 		 424 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  28.85 
 
 		 409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  29.72 
 
 		 411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  30.77 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  28.95 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  30.11 
 
 		 414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  28.93 
 
 		 417 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  28.29 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  28.11 
 
 		 411 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  29.21 
 
 		 411 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  31.28 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  30.35 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  27.7 
 
 		 420 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  30.13 
 
 		 440 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  28.99 
 
 		 408 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  30.36 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  27.66 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  31.18 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  27.42 
 
 		 420 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  30.65 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  27.2 
 
 		 407 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  26.13 
 
 		 422 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  26.39 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  31.02 
 
 		 407 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  27.59 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  27.85 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  30.18 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  32.25 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  29.51 
 
 		 402 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  27.85 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  29.52 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  29.01 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  30.25 
 
 		 407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  30.03 
 
 		 452 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  27.93 
 
 		 417 aa  133  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  27.66 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  28.2 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  29.52 
 
 		 395 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  27.9 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  27.32 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  29.13 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  29.41 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  28.72 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  27.41 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  28.23 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  25.26 
 
 		 382 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  27.44 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  26.98 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  25.73 
 
 		 433 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  28.57 
 
 		 422 aa  116  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  26.89 
 
 		 438 aa  116  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  29.03 
 
 		 437 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  27.69 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  27.22 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  26.77 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  24.69 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  28.65 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  25.94 
 
 		 432 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  27.04 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  27.12 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  27.51 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  29.48 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0408  putative esterase  31.15 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0970  putative esterase  31.15 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.216646  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1365  putative esterase  31.15 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99407  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0233  putative esterase  31.15 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  29.87 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>