More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2265 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
428 aa  849    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  56.44 
 
 
431 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  33.75 
 
 
445 aa  229  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  36.95 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  36.53 
 
 
414 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  35.48 
 
 
405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  36.14 
 
 
418 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  36.46 
 
 
420 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  36.46 
 
 
420 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  34.96 
 
 
405 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  32.72 
 
 
419 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  37.22 
 
 
405 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  34.67 
 
 
438 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  35.79 
 
 
433 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  34.86 
 
 
424 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  36.21 
 
 
399 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  34.09 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  35.47 
 
 
370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  34.71 
 
 
407 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  33.75 
 
 
411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  35.65 
 
 
417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  33.42 
 
 
402 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  35.53 
 
 
408 aa  196  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  35.38 
 
 
420 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  35.43 
 
 
408 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  33.08 
 
 
422 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  36.52 
 
 
427 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  33.61 
 
 
407 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  35.42 
 
 
420 aa  193  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  34.05 
 
 
424 aa  192  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  35.46 
 
 
468 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  35.38 
 
 
407 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  34.26 
 
 
420 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  35.63 
 
 
407 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  34.43 
 
 
424 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  34.77 
 
 
417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  33.87 
 
 
411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  35.1 
 
 
409 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  34.25 
 
 
454 aa  182  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  35.11 
 
 
409 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  32.35 
 
 
414 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  36.59 
 
 
425 aa  180  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  37.24 
 
 
452 aa  180  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  34.29 
 
 
426 aa  179  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  32.93 
 
 
431 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  33.33 
 
 
447 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  32.29 
 
 
424 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  34.01 
 
 
411 aa  176  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  31.95 
 
 
613 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  34.48 
 
 
414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  34.79 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  34.79 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  37.25 
 
 
437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  33.61 
 
 
440 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  35.86 
 
 
436 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  34.52 
 
 
401 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  37.41 
 
 
444 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  34.67 
 
 
440 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  33.15 
 
 
430 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  31.58 
 
 
430 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  31.98 
 
 
426 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  33.7 
 
 
401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  30 
 
 
415 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  32.08 
 
 
423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  32.69 
 
 
410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  32.89 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  33.24 
 
 
418 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  33.92 
 
 
412 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  30.83 
 
 
407 aa  164  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  34.96 
 
 
401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  32.39 
 
 
453 aa  163  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  34.73 
 
 
395 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  33.7 
 
 
394 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  31.39 
 
 
395 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  33.52 
 
 
401 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  30.81 
 
 
438 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4066  beta-lactamase  36.2 
 
 
385 aa  159  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  33.53 
 
 
422 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  30.29 
 
 
395 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  33.86 
 
 
382 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  34.78 
 
 
400 aa  158  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  33.88 
 
 
437 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  29.79 
 
 
438 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  30.1 
 
 
395 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  29.35 
 
 
435 aa  154  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2104  beta-lactamase  30.73 
 
 
396 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  31.97 
 
 
422 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02730  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.38 
 
 
375 aa  147  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104017  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  31.72 
 
 
389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1611  beta-lactamase  33.96 
 
 
411 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  29.12 
 
 
377 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  32.26 
 
 
397 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  31.4 
 
 
427 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0089  beta-lactamase  28.9 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  33.08 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3462  beta-lactamase  30.79 
 
 
406 aa  140  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00219099  normal  0.0121501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1072  beta-lactamase  29.63 
 
 
410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22387  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05480  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.07 
 
 
380 aa  137  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  29.5 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  31.19 
 
 
391 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>