More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0870 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  100 
 
 		 410 aa  837    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  56.28 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  54.44 
 
 		 420 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  54.44 
 
 		 420 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  52.91 
 
 		 408 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  54.5 
 
 		 420 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  55.7 
 
 		 417 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  53.87 
 
 		 422 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  54 
 
 		 418 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  53.5 
 
 		 420 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  54.22 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  51.56 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  49.88 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  48.56 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  49.88 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  49.75 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  50 
 
 		 370 aa  349  5e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  46.59 
 
 		 445 aa  346  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  46.91 
 
 		 414 aa  345  8e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  47.19 
 
 		 406 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  46.78 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  46.15 
 
 		 405 aa  335  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  45.68 
 
 		 407 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  46.55 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  46.38 
 
 		 417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  41.46 
 
 		 412 aa  287  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  43.46 
 
 		 438 aa  285  8e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  38.61 
 
 		 419 aa  285  8e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  42.36 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  41.06 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  40.88 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  41.09 
 
 		 411 aa  262  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  40.39 
 
 		 407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  39.75 
 
 		 402 aa  259  8e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  39.95 
 
 		 426 aa  255  9e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  38.13 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  40.1 
 
 		 409 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  37.32 
 
 		 411 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  37.5 
 
 		 447 aa  245  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  37.29 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  38.13 
 
 		 415 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  39.69 
 
 		 613 aa  242  9e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  40.14 
 
 		 453 aa  239  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  36.19 
 
 		 433 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  36.41 
 
 		 399 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  39.07 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  37.53 
 
 		 423 aa  236  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  38.06 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  38.98 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  38.5 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  38.98 
 
 		 431 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  36.27 
 
 		 427 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  37.06 
 
 		 452 aa  229  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  36.45 
 
 		 408 aa  229  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  36.93 
 
 		 454 aa  229  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  36.63 
 
 		 424 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  33.9 
 
 		 435 aa  219  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  36.43 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  38.46 
 
 		 414 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  36.08 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  38.52 
 
 		 430 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  36.76 
 
 		 409 aa  206  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  38.26 
 
 		 436 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  38.98 
 
 		 401 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  38.98 
 
 		 401 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  38.98 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  38.05 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  36.16 
 
 		 425 aa  202  7e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  34.9 
 
 		 444 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  35.97 
 
 		 468 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  35.12 
 
 		 401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  33.33 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  36.93 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  35.77 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  33.82 
 
 		 431 aa  191  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  36.65 
 
 		 437 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  35.38 
 
 		 394 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  30.48 
 
 		 427 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  35.42 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  31.46 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  32.22 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1611  beta-lactamase  33.58 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  34.24 
 
 		 419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  33.1 
 
 		 438 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  30.15 
 
 		 437 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  30.77 
 
 		 431 aa  172  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  33.42 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  30.75 
 
 		 395 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  29.95 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  31.76 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  30.75 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  32.01 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  31.29 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  31.29 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  33.24 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  33.18 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  30.3 
 
 		 409 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  30.94 
 
 		 396 aa  156  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02730  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.33 
 
 		 375 aa  155  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104017  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl600  putative beta-lactamase  26.65 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>