More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5786 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  82.66 
 
 		 420 aa  711    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  88.04 
 
 		 418 aa  764    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  82.66 
 
 		 420 aa  711    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  100 
 
 		 420 aa  859    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  65.53 
 
 		 424 aa  556  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  63.59 
 
 		 424 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  62.65 
 
 		 408 aa  541  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  64.94 
 
 		 420 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  63.88 
 
 		 420 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  63.29 
 
 		 424 aa  533  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  63.39 
 
 		 422 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  65.16 
 
 		 417 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  59.22 
 
 		 414 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  54.07 
 
 		 410 aa  408  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  50 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  53.46 
 
 		 370 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  51.59 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  48.77 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  51.72 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  53.22 
 
 		 406 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  48.88 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  49.13 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  47.65 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  48.88 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  45.34 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  40.69 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  40.77 
 
 		 411 aa  293  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  40.29 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  40.53 
 
 		 438 aa  283  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  40.76 
 
 		 440 aa  273  6e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  39.32 
 
 		 412 aa  271  2e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  41.77 
 
 		 418 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  39.19 
 
 		 454 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  40.38 
 
 		 407 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  39.52 
 
 		 433 aa  265  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  39.61 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  40.53 
 
 		 407 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  39.71 
 
 		 407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  37.56 
 
 		 402 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  37.47 
 
 		 424 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  39.17 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  38.73 
 
 		 399 aa  253  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  39.13 
 
 		 426 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  36.47 
 
 		 423 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  38.72 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  40.71 
 
 		 453 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  38.81 
 
 		 415 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  36.89 
 
 		 430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  37.93 
 
 		 431 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  37.19 
 
 		 426 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  38.38 
 
 		 427 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  38.14 
 
 		 411 aa  239  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  37.9 
 
 		 409 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  38.94 
 
 		 414 aa  236  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  35.35 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  36.12 
 
 		 613 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  36.64 
 
 		 452 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  37.76 
 
 		 430 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  37.06 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  37.3 
 
 		 401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  37.3 
 
 		 401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  36.02 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  37.4 
 
 		 401 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  33.33 
 
 		 435 aa  212  9e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  36.25 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  36.73 
 
 		 440 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  37.1 
 
 		 436 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  36.62 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  34.4 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  36.52 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  35.1 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  35.45 
 
 		 444 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  33.88 
 
 		 438 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  35.37 
 
 		 431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  31.65 
 
 		 427 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  33.57 
 
 		 438 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  33.25 
 
 		 409 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  32.66 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  33.07 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  31.75 
 
 		 432 aa  187  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  32.59 
 
 		 416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  31.44 
 
 		 395 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  31.35 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  36.24 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  34.03 
 
 		 394 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  34.15 
 
 		 422 aa  173  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  30.93 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  31.29 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  31.3 
 
 		 391 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  32.59 
 
 		 409 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  33.16 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  30.64 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  32.72 
 
 		 389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1611  beta-lactamase  32.2 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  33.07 
 
 		 419 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  31.88 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  32.14 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  32.14 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  29.74 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0394  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  31.08 
 
 		 397 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>