More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5491 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  100 
 
 
407 aa  809    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  70.32 
 
 
405 aa  566  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  70.75 
 
 
405 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  68.08 
 
 
406 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  70.07 
 
 
405 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  68.42 
 
 
414 aa  548  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  50.62 
 
 
418 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  51.05 
 
 
417 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  48.92 
 
 
424 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  47.74 
 
 
424 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  48.87 
 
 
420 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  49.37 
 
 
420 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  48.87 
 
 
422 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  47.28 
 
 
445 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  51.09 
 
 
370 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  47.51 
 
 
424 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  51.69 
 
 
414 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  47.01 
 
 
408 aa  362  7.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  47.9 
 
 
420 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  47.9 
 
 
420 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  47.65 
 
 
420 aa  353  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  47.61 
 
 
417 aa  338  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  45.14 
 
 
400 aa  319  5e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  45.68 
 
 
410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  43.77 
 
 
406 aa  308  8e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  39.65 
 
 
419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  46.38 
 
 
412 aa  289  7e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  42.14 
 
 
438 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  40.1 
 
 
411 aa  277  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  40.43 
 
 
411 aa  275  8e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  39.85 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  38.41 
 
 
440 aa  272  9e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  39.46 
 
 
407 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  41.18 
 
 
426 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  40.29 
 
 
409 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  38.78 
 
 
407 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  41.4 
 
 
402 aa  262  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  38.29 
 
 
408 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  37.89 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  41.83 
 
 
453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  38.2 
 
 
424 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  37.62 
 
 
411 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  36.65 
 
 
431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  37.35 
 
 
407 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  35.77 
 
 
430 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  39.52 
 
 
415 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  39.79 
 
 
613 aa  236  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  35.22 
 
 
447 aa  235  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  34.89 
 
 
435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  37.19 
 
 
423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  35.04 
 
 
433 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  37.09 
 
 
399 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  36.32 
 
 
425 aa  229  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  34.71 
 
 
426 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  36.54 
 
 
452 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  35.21 
 
 
418 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  39.63 
 
 
399 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  35.02 
 
 
427 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  39.12 
 
 
427 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  38.93 
 
 
414 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  33.66 
 
 
422 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  35.04 
 
 
444 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  31.41 
 
 
382 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  34.75 
 
 
430 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  37.74 
 
 
401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  37.74 
 
 
401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  37.26 
 
 
401 aa  199  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  35.9 
 
 
440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  37.85 
 
 
401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  35.99 
 
 
395 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  36.77 
 
 
394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  36.94 
 
 
436 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  34.34 
 
 
395 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  35.16 
 
 
395 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  36.74 
 
 
401 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  39.95 
 
 
391 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  33.6 
 
 
437 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  33.59 
 
 
468 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  35.69 
 
 
401 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  36.53 
 
 
389 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  33.08 
 
 
438 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  33.89 
 
 
422 aa  186  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  36.17 
 
 
395 aa  186  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  33.95 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  34.07 
 
 
438 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  35.28 
 
 
397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  33.87 
 
 
419 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  38.54 
 
 
398 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  38.54 
 
 
398 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  34.96 
 
 
409 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  35.56 
 
 
409 aa  176  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  35.88 
 
 
396 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  38.02 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  36.22 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1072  beta-lactamase  35.17 
 
 
410 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22387  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  35.63 
 
 
428 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  35 
 
 
397 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  34.75 
 
 
431 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3034  beta-lactamase  38.27 
 
 
413 aa  169  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396527  normal  0.941046 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0639  putative esterase  39.27 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.74574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>