More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2230 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2230  beta-lactamase  100 
 
 		 380 aa  725    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5065  beta-lactamase  53.12 
 
 		 373 aa  333  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  41.16 
 
 		 409 aa  245  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  39.55 
 
 		 468 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  40.1 
 
 		 416 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4066  beta-lactamase  42.64 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  41.38 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02730  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  39.01 
 
 		 375 aa  179  7e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1611  beta-lactamase  38.71 
 
 		 411 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  38.74 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  36.06 
 
 		 399 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  35.81 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05480  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  36.86 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  34.2 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  34.37 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  37.47 
 
 		 401 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  37.09 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  37.09 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  31.56 
 
 		 424 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  34.31 
 
 		 407 aa  163  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  36.39 
 
 		 401 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  30.58 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  30.29 
 
 		 445 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  33.24 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  32.35 
 
 		 417 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  36.75 
 
 		 409 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  30.56 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  32.64 
 
 		 409 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  35.29 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  32.29 
 
 		 407 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  30.95 
 
 		 422 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  30.03 
 
 		 420 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  33.33 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  35.83 
 
 		 401 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  30.97 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  31.88 
 
 		 436 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  32.98 
 
 		 417 aa  149  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  35.62 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  30.25 
 
 		 430 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  32.53 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  30.43 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  35.09 
 
 		 453 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  30.61 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  34.23 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  27.06 
 
 		 419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  32.53 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  30.35 
 
 		 440 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  32.26 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  32.12 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  31.15 
 
 		 613 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  31.48 
 
 		 411 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  35.2 
 
 		 389 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  36.56 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  32.53 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  29.51 
 
 		 424 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  35.26 
 
 		 407 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  30.92 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  28.61 
 
 		 433 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  29.43 
 
 		 437 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  33.78 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  31.3 
 
 		 415 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  32.7 
 
 		 405 aa  135  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  34.75 
 
 		 398 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  34.75 
 
 		 398 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  31.88 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  32.26 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  32.1 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  28.34 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  32.42 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  30.16 
 
 		 430 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  29.22 
 
 		 423 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  31.66 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  32.86 
 
 		 428 aa  133  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  32.08 
 
 		 405 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  31.47 
 
 		 438 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  31.9 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  30.81 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  30.59 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  30.59 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  34.79 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  30.71 
 
 		 418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  34.48 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  26.95 
 
 		 377 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6825  beta-lactamase  35.92 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  33.42 
 
 		 393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  29.38 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  29.85 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0402  beta-lactamase  34.34 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00394756  normal  0.302831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  29.18 
 
 		 420 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  28.12 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1817  beta-lactamase  31.23 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  31.82 
 
 		 410 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2956  esterase  32.42 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0198492  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2923  beta-lactamase  33.42 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  33.16 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  29.89 
 
 		 438 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0329  beta-lactamase  32.31 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.021088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1775  putative esterase  32.31 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1860  putative esterase  32.31 
 
 		 399 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  33.06 
 
 		 431 aa  123  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>