More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6825 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6825  beta-lactamase  100 
 
 
382 aa  729    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  59.04 
 
 
391 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  57.07 
 
 
396 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  57.26 
 
 
397 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  54.97 
 
 
393 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  54.88 
 
 
404 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  55.2 
 
 
397 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1817  beta-lactamase  55.91 
 
 
397 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  57.67 
 
 
398 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  57.67 
 
 
398 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  55.76 
 
 
396 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  57.14 
 
 
398 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  54.09 
 
 
393 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  51.75 
 
 
409 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  57.67 
 
 
398 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2474  putative esterase  57.55 
 
 
398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.506613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0087  putative esterase  57.55 
 
 
398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0340  esterase, putative  57.55 
 
 
398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0639  putative esterase  57.55 
 
 
398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.74574  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  53.4 
 
 
389 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3034  beta-lactamase  56.8 
 
 
413 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396527  normal  0.941046 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  52.88 
 
 
389 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0884  putative esterase  57.29 
 
 
398 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1043  beta-lactamase  57.29 
 
 
398 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0881  putative esterase  57.29 
 
 
398 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5920  Beta-lactamase  57.42 
 
 
398 aa  349  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0402  beta-lactamase  53.99 
 
 
392 aa  335  5.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00394756  normal  0.302831 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2661  beta-lactamase  50.27 
 
 
377 aa  311  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220174  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1860  putative esterase  50.68 
 
 
399 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0408  putative esterase  50.41 
 
 
399 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0233  putative esterase  50.41 
 
 
399 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0970  putative esterase  50.41 
 
 
399 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.216646  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1365  putative esterase  50.41 
 
 
404 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99407  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0329  beta-lactamase  50.14 
 
 
399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.021088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1775  putative esterase  50.14 
 
 
399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1108  beta-lactamase  51.72 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2275  beta-lactamase  46.49 
 
 
383 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0956783 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2741  Beta-lactamase  46.87 
 
 
396 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2923  beta-lactamase  47.66 
 
 
394 aa  272  8.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2956  esterase  43.82 
 
 
384 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0198492  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4084  esterase (beta-lactamase family)  41.15 
 
 
410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  32.98 
 
 
424 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  34.73 
 
 
406 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  37.6 
 
 
407 aa  166  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  34.73 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  29.84 
 
 
433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  31.62 
 
 
424 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  28.75 
 
 
447 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  29.62 
 
 
445 aa  162  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  34.46 
 
 
399 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2945  esterase EstB  58.27 
 
 
206 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  34.82 
 
 
405 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  33.85 
 
 
414 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  32.53 
 
 
399 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  33.78 
 
 
440 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  34.55 
 
 
405 aa  159  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  33.6 
 
 
427 aa  159  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  32.12 
 
 
418 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  31.82 
 
 
420 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  29.5 
 
 
419 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  32.8 
 
 
417 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  31.72 
 
 
402 aa  155  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  34.57 
 
 
407 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  35.31 
 
 
405 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  30.81 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  32.42 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  30.91 
 
 
424 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  30.71 
 
 
422 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  32.99 
 
 
408 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  32.28 
 
 
426 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  33.33 
 
 
401 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  32.58 
 
 
412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  32.13 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  32.13 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  29.52 
 
 
420 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  31.01 
 
 
420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  29.61 
 
 
395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  30.77 
 
 
438 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  29.02 
 
 
427 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  31.25 
 
 
395 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  35.39 
 
 
414 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  32.9 
 
 
401 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  30.57 
 
 
426 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  31.11 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  31.51 
 
 
409 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  33.33 
 
 
401 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  29.92 
 
 
411 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  33.33 
 
 
401 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  33.33 
 
 
401 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  29.56 
 
 
452 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  31.78 
 
 
411 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  30.1 
 
 
454 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  31.76 
 
 
401 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0093  beta-lactamase, putative  24.66 
 
 
375 aa  134  3e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  30.77 
 
 
411 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  30.25 
 
 
425 aa  134  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  29.54 
 
 
435 aa  133  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  30.26 
 
 
410 aa  132  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  28.24 
 
 
408 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  30.45 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>