More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0093 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0093  beta-lactamase, putative  100 
 
 		 375 aa  753    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl216  putative beta-lactamase  45.14 
 
 		 372 aa  329  4e-89  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl600  putative beta-lactamase  44.84 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  26.74 
 
 		 411 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  27.06 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  28.28 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  27.3 
 
 		 414 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  27.27 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  26.77 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  27.25 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  27.48 
 
 		 431 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  26.39 
 
 		 440 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  25.49 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  31.08 
 
 		 447 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  28.12 
 
 		 407 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  25.43 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  26.22 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  26.21 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  30.64 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  26.67 
 
 		 420 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  28.42 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  25.8 
 
 		 430 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  26.67 
 
 		 407 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  26.38 
 
 		 417 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  26.4 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  24.53 
 
 		 407 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  25.98 
 
 		 427 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  26.2 
 
 		 424 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  22.91 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  27.81 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  26.77 
 
 		 423 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  26.11 
 
 		 424 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  24.87 
 
 		 409 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  25.26 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  26.12 
 
 		 409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  25.46 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  25.38 
 
 		 422 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  25.2 
 
 		 445 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  25.27 
 
 		 411 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  26.55 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  26.55 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  25.56 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  24.48 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  27.35 
 
 		 418 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  24.31 
 
 		 414 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  24.06 
 
 		 410 aa  129  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  22.52 
 
 		 412 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  25.74 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  25.55 
 
 		 436 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  22.94 
 
 		 407 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  23.36 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  23.94 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  27.23 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  25.27 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6825  beta-lactamase  24.66 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  26.49 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  25.77 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  23.68 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  23.12 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  24.24 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  23.45 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  23.18 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  26.15 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  26.29 
 
 		 432 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  23.26 
 
 		 398 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  23.26 
 
 		 398 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  26.46 
 
 		 427 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  25.63 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  25.2 
 
 		 425 aa  118  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2275  beta-lactamase  27.15 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0956783 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  23.54 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  22.41 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  22.64 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  21.94 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  25.82 
 
 		 389 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  24.4 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  22.74 
 
 		 396 aa  115  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  23.01 
 
 		 438 aa  115  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  22.05 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  22.86 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  24.93 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  25.35 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  23.73 
 
 		 399 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  24.28 
 
 		 393 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  22.69 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88817  1,4-butanediol diacrylate esterase  27.34 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  25.07 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  22.69 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  22.69 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  23.58 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  21.65 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  22.94 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  22.55 
 
 		 613 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  23.9 
 
 		 399 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1860  putative esterase  21.9 
 
 		 399 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2741  Beta-lactamase  22.72 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1817  beta-lactamase  22.72 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  24.72 
 
 		 452 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3034  beta-lactamase  24.1 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396527  normal  0.941046 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1775  putative esterase  21.9 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>