More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5920 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  85.46 
 
 
398 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5920  Beta-lactamase  100 
 
 
398 aa  769    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  84.92 
 
 
398 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  84.92 
 
 
398 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  83.17 
 
 
398 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  81.42 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2474  putative esterase  69.37 
 
 
398 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.506613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0340  esterase, putative  69.37 
 
 
398 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0087  putative esterase  69.37 
 
 
398 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0639  putative esterase  69.37 
 
 
398 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.74574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1043  beta-lactamase  69.11 
 
 
398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0884  putative esterase  69.11 
 
 
398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23469  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0881  putative esterase  69.11 
 
 
398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  64.21 
 
 
404 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  64.29 
 
 
393 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  63.52 
 
 
393 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  59.59 
 
 
396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  60.32 
 
 
391 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  59.37 
 
 
397 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  58.2 
 
 
397 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1817  beta-lactamase  58.82 
 
 
397 aa  413  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3034  beta-lactamase  61.78 
 
 
413 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396527  normal  0.941046 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  54.57 
 
 
409 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0402  beta-lactamase  54.04 
 
 
392 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00394756  normal  0.302831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  53.09 
 
 
389 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  52.58 
 
 
389 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1860  putative esterase  55.56 
 
 
399 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6825  beta-lactamase  57.42 
 
 
382 aa  348  7e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0329  beta-lactamase  55.28 
 
 
399 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.021088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1775  putative esterase  55.28 
 
 
399 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0233  putative esterase  55.01 
 
 
399 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0970  putative esterase  55.01 
 
 
399 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.216646  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1365  putative esterase  55.01 
 
 
404 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99407  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0408  putative esterase  55.01 
 
 
399 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1108  beta-lactamase  55.08 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2275  beta-lactamase  45.6 
 
 
383 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0956783 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2661  beta-lactamase  48.76 
 
 
377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220174  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2956  esterase  43.16 
 
 
384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0198492  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2923  beta-lactamase  45.66 
 
 
394 aa  269  7e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2741  Beta-lactamase  43.97 
 
 
396 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4084  esterase (beta-lactamase family)  38.55 
 
 
410 aa  226  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  34.04 
 
 
424 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  35.45 
 
 
417 aa  177  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  38.2 
 
 
407 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  34.78 
 
 
412 aa  170  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  31.23 
 
 
445 aa  169  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  36.07 
 
 
399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  34.97 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  36.53 
 
 
414 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  28.76 
 
 
447 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  27.81 
 
 
419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  36.51 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  32.39 
 
 
420 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  34.18 
 
 
402 aa  163  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  31.13 
 
 
433 aa  162  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  31.77 
 
 
424 aa  162  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  34.53 
 
 
414 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  35.23 
 
 
406 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  33.84 
 
 
407 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  33.78 
 
 
409 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  31.06 
 
 
422 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  30.94 
 
 
408 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  32.56 
 
 
417 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  32.05 
 
 
407 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  31.13 
 
 
411 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  31.79 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  31.63 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  31.19 
 
 
424 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  35.73 
 
 
408 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2945  esterase EstB  56.52 
 
 
206 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  32.67 
 
 
426 aa  149  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  34.63 
 
 
453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  32.12 
 
 
418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  31.63 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  30.96 
 
 
407 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  31.03 
 
 
400 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  34.1 
 
 
414 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  32.33 
 
 
420 aa  146  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  32.33 
 
 
420 aa  146  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  31.11 
 
 
424 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  31.09 
 
 
426 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  32.64 
 
 
425 aa  143  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  32.46 
 
 
405 aa  142  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  30.39 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  30.87 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  32.46 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  39.45 
 
 
418 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  31.78 
 
 
423 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  30.37 
 
 
431 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  31.49 
 
 
438 aa  137  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  31.75 
 
 
440 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  30.45 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  31.05 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  27.54 
 
 
427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  31.85 
 
 
401 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  32.08 
 
 
401 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  32.97 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  31.08 
 
 
454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  32.54 
 
 
427 aa  131  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  29.92 
 
 
435 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>