More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4038 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4038  beta-lactamase  100 
 
 		 374 aa  704    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  38.48 
 
 		 582 aa  192  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  43.95 
 
 		 348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  44.75 
 
 		 371 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  36.96 
 
 		 566 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  38.04 
 
 		 966 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  36.69 
 
 		 717 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  41.02 
 
 		 415 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  33.43 
 
 		 395 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  30.88 
 
 		 574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  33.97 
 
 		 379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  36.31 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  33.05 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  35.09 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  41.79 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  34.65 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  40.7 
 
 		 344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  34.74 
 
 		 591 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  34.25 
 
 		 784 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  31.97 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  35.51 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  36.78 
 
 		 790 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3827  beta-lactamase  39.15 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0809801  normal  0.0296333 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  30.95 
 
 		 379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.36 
 
 		 385 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  35.05 
 
 		 361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  35.56 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  32.99 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  38.07 
 
 		 796 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  38.07 
 
 		 796 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  30.77 
 
 		 366 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2590  beta-lactamase  35.82 
 
 		 333 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  30.9 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  29.78 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  34.31 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  35.76 
 
 		 792 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  34.02 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  32.34 
 
 		 793 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  38.21 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  36.07 
 
 		 785 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  32.53 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  35.63 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  31.14 
 
 		 336 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  32.77 
 
 		 428 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3659  beta-lactamase  36.64 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  35.29 
 
 		 452 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  28.26 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  31.31 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  28.77 
 
 		 603 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  27.08 
 
 		 990 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  34.33 
 
 		 459 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  25.46 
 
 		 992 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.38 
 
 		 953 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3541  beta-lactamase  35.67 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437558  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3130  beta-lactamase  33.22 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  29.33 
 
 		 347 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3477  beta-lactamase  35.67 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3808  beta-lactamase  33.02 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00436578 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  30.47 
 
 		 483 aa  99.8  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3394  Beta-lactamase  35.38 
 
 		 394 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  30.64 
 
 		 416 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.85 
 
 		 1018 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  30.61 
 
 		 395 aa  96.3  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  28.31 
 
 		 1012 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  25.73 
 
 		 597 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.73 
 
 		 1002 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  27.11 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  31.7 
 
 		 471 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1130  beta-lactamase  31.9 
 
 		 355 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  29.01 
 
 		 430 aa  93.6  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4212  beta-lactamase  34.63 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  32.38 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  27.53 
 
 		 651 aa  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  29.17 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  25.45 
 
 		 665 aa  91.3  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  29.57 
 
 		 528 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  29.57 
 
 		 528 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  25.2 
 
 		 997 aa  90.9  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1729  hypothetical protein  26.01 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00956707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  30.55 
 
 		 429 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  28.71 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  29.78 
 
 		 531 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  26.84 
 
 		 1003 aa  88.6  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1629  hypothetical protein  26.91 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000178179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  29.78 
 
 		 547 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  30.82 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.01 
 
 		 399 aa  86.7  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  30.37 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.52 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  35.47 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  36.31 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  22.87 
 
 		 971 aa  83.2  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  39.31 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.5 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  23.49 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1007 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  28.33 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.52 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  28.71 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  28.18 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.303061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>