170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0220 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0220  putative secreted esterase  100 
 
 		 339 aa  684    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146113  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4212  beta-lactamase  64.31 
 
 		 343 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1130  beta-lactamase  35.15 
 
 		 355 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  35.54 
 
 		 369 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  30.97 
 
 		 483 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  31.91 
 
 		 793 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  32.93 
 
 		 452 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  32.93 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  31.37 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.86 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  30.88 
 
 		 574 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  31.31 
 
 		 390 aa  116  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  33.03 
 
 		 966 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  28.7 
 
 		 379 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  30.97 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  30.65 
 
 		 459 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  30.31 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  29.88 
 
 		 379 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  31.53 
 
 		 796 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  31.53 
 
 		 796 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2334  hypothetical protein  26.45 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000883594  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1629  hypothetical protein  29.11 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000178179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  32.23 
 
 		 784 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  29.79 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  32.53 
 
 		 591 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  30.11 
 
 		 395 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  28.12 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  29.43 
 
 		 471 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.01 
 
 		 582 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  32.46 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  28.05 
 
 		 531 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  34.38 
 
 		 566 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  28.19 
 
 		 381 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  29.6 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  28.88 
 
 		 379 aa  99.4  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  33.75 
 
 		 790 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  28.06 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  33.64 
 
 		 792 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  27.96 
 
 		 528 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  27.96 
 
 		 528 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  28.12 
 
 		 336 aa  96.3  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  30.09 
 
 		 360 aa  95.9  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  32.53 
 
 		 717 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  27.14 
 
 		 496 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  32.82 
 
 		 785 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  33.45 
 
 		 348 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  27.67 
 
 		 391 aa  93.2  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1729  hypothetical protein  26.71 
 
 		 309 aa  92.8  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00956707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  31.54 
 
 		 415 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  26.28 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.73 
 
 		 1018 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  28.13 
 
 		 397 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  28.4 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  30.51 
 
 		 357 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  25.36 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  28.36 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  30.07 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.41 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  28.89 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  28.61 
 
 		 818 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  28.15 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  31.13 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  31.68 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  31.31 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2590  beta-lactamase  34.02 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  24.18 
 
 		 665 aa  77.8  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  25.81 
 
 		 1012 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  29.35 
 
 		 434 aa  76.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  27.71 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  25.27 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  25.27 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  25.27 
 
 		 432 aa  75.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.94 
 
 		 1002 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  25.27 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.45 
 
 		 953 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  27.02 
 
 		 992 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  24.66 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3827  beta-lactamase  28.41 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0809801  normal  0.0296333 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3130  beta-lactamase  29.56 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  26.63 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  26.63 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.303061 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  25.85 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  27.27 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3808  beta-lactamase  28.62 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00436578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  25.73 
 
 		 603 aa  70.1  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3541  beta-lactamase  33.04 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  25.43 
 
 		 433 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  23.72 
 
 		 971 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  24.92 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3477  beta-lactamase  32.54 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3394  Beta-lactamase  31.99 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  26.95 
 
 		 434 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3659  beta-lactamase  24.1 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  26.17 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  25.75 
 
 		 597 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1007 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.47 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  26.27 
 
 		 510 aa  62.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  24.91 
 
 		 651 aa  61.6  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4038  beta-lactamase  28.62 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>