165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3130 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3130  beta-lactamase  100 
 
 
304 aa  626  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3808  beta-lactamase  60.73 
 
 
323 aa  354  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00436578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2590  beta-lactamase  46.56 
 
 
333 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  46.1 
 
 
334 aa  246  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  43.33 
 
 
344 aa  219  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  34.18 
 
 
375 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  34.16 
 
 
360 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  34.49 
 
 
361 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  32.57 
 
 
966 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  32.81 
 
 
354 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  31.78 
 
 
793 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  33.55 
 
 
784 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  31.39 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  32.87 
 
 
574 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  30.75 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  33.1 
 
 
379 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  32.13 
 
 
591 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  31.76 
 
 
366 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  33.33 
 
 
566 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  31.36 
 
 
379 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  32.27 
 
 
392 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  29.68 
 
 
337 aa  105  8e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  30.56 
 
 
379 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  33.13 
 
 
391 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3477  beta-lactamase  32.05 
 
 
394 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  28.47 
 
 
339 aa  99.8  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  28.1 
 
 
377 aa  99.4  7e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  32.27 
 
 
790 aa  99  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3541  beta-lactamase  30.96 
 
 
394 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437558  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  30.42 
 
 
395 aa  99  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  35.28 
 
 
348 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.17 
 
 
385 aa  97.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.79 
 
 
582 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  30.05 
 
 
394 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  31.03 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  32.13 
 
 
796 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.42 
 
 
381 aa  97.4  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  32.13 
 
 
796 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  29.87 
 
 
390 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3394  Beta-lactamase  31.06 
 
 
394 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.69 
 
 
953 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  30.33 
 
 
381 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  30.98 
 
 
452 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  30.98 
 
 
428 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  26.71 
 
 
971 aa  92.4  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  30.52 
 
 
381 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  33.77 
 
 
415 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  30.49 
 
 
717 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  30.14 
 
 
483 aa  89.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.24 
 
 
1018 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  30.18 
 
 
785 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  31.85 
 
 
408 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  28.53 
 
 
1012 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  29.8 
 
 
459 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  33.1 
 
 
369 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  27.56 
 
 
603 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  31.12 
 
 
395 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2334  hypothetical protein  28.52 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000883594  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  28.07 
 
 
792 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4038  beta-lactamase  33.57 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4212  beta-lactamase  31.16 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  31.11 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  27.36 
 
 
651 aa  82  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1130  beta-lactamase  29.78 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  29.26 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  25.08 
 
 
992 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  24.67 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  23.68 
 
 
665 aa  78.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.25 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  26.42 
 
 
818 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  28.48 
 
 
547 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  25.74 
 
 
528 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  25.74 
 
 
528 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  25.74 
 
 
531 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  22.57 
 
 
1002 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0220  putative secreted esterase  29.56 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146113  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  24.39 
 
 
597 aa  72.8  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  28.44 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  29.9 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  29.55 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  26.01 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  26.67 
 
 
484 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  24.39 
 
 
990 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  27.19 
 
 
433 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  27.08 
 
 
434 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  32.07 
 
 
1003 aa  64.7  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1729  hypothetical protein  25 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00956707  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  26.59 
 
 
434 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  23.5 
 
 
1007 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  26.59 
 
 
434 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1629  hypothetical protein  25.1 
 
 
318 aa  63.5  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000178179  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  27.1 
 
 
432 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  26.28 
 
 
434 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3659  beta-lactamase  26.91 
 
 
374 aa  62.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  24.86 
 
 
496 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  26.49 
 
 
434 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  26.45 
 
 
432 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  26.45 
 
 
432 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  26.45 
 
 
432 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  26.45 
 
 
432 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>