More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3827 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3827  beta-lactamase  100 
 
 		 326 aa  612  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0809801  normal  0.0296333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4038  beta-lactamase  39.19 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  32.46 
 
 		 566 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.44 
 
 		 582 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  36.42 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  33.97 
 
 		 717 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  31.87 
 
 		 796 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  31.87 
 
 		 796 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  30.48 
 
 		 591 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  26.67 
 
 		 574 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  33.54 
 
 		 792 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  32.61 
 
 		 354 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  27.49 
 
 		 395 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  33.23 
 
 		 785 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  34.15 
 
 		 415 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  31.61 
 
 		 360 aa  95.9  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  35.46 
 
 		 369 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  26.32 
 
 		 379 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  34.19 
 
 		 784 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  29.86 
 
 		 385 aa  94  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  31.73 
 
 		 357 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  31.11 
 
 		 334 aa  93.2  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  29.13 
 
 		 361 aa  93.2  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  32.5 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  35.03 
 
 		 371 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  30.9 
 
 		 966 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  25.78 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  36.93 
 
 		 790 aa  88.6  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  27.41 
 
 		 793 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  29.79 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  30 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  27.43 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.35 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  26.3 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  30.47 
 
 		 459 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  30.63 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  30 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2590  beta-lactamase  32.6 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2334  hypothetical protein  26.94 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000883594  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  25.23 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  29.41 
 
 		 528 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  29.41 
 
 		 528 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  29.8 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  31.08 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.36 
 
 		 487 aa  79.3  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  29.43 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  26.92 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4212  beta-lactamase  28.9 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  23.4 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  29.41 
 
 		 531 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  24.6 
 
 		 651 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  32.94 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  26.91 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  25.94 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  28.68 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  25.36 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  26.69 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  25.07 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  26.76 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  25.07 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0220  putative secreted esterase  28.41 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  25.07 
 
 		 434 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  25.07 
 
 		 434 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  29.03 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.41 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1130  beta-lactamase  27.11 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  22.75 
 
 		 665 aa  72.4  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  25.31 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  25.98 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  30.91 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  26.62 
 
 		 470 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  20.59 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  20.96 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.37 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  22.42 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  27.24 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  26.19 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  28.47 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.57 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1729  hypothetical protein  21.99 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00956707  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  34.86 
 
 		 611 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  33.33 
 
 		 603 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  33.33 
 
 		 593 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  26.16 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  20.07 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  34.5 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  20.29 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  24.92 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  31.36 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  24.52 
 
 		 578 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.37 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  20.59 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  20.59 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  20.59 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  20.59 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  24.62 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  24.62 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  24.62 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  20.78 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  24.62 
 
 		 432 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>