More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1713 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  100 
 
 		 347 aa  722    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  34.49 
 
 		 966 aa  162  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  32.85 
 
 		 395 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  36.64 
 
 		 582 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  34.04 
 
 		 574 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  33.24 
 
 		 452 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  33.24 
 
 		 428 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  28.64 
 
 		 382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3866  beta-lactamase  31.1 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  31.55 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  34.02 
 
 		 796 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  34.02 
 
 		 796 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  31.96 
 
 		 784 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  31.49 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  34.95 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  29.46 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  34.03 
 
 		 566 aa  129  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  29.68 
 
 		 420 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  28.72 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  31.23 
 
 		 793 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  33.68 
 
 		 381 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  28.78 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  32.78 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  31.61 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  32.19 
 
 		 717 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  31.4 
 
 		 419 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  29.39 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  31.44 
 
 		 411 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  28.28 
 
 		 423 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  33.94 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  31.41 
 
 		 402 aa  123  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  28.21 
 
 		 424 aa  122  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  29.2 
 
 		 379 aa  122  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.95 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  29.02 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  31.91 
 
 		 364 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1551  beta-lactamase  31.08 
 
 		 375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0670758  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  27.55 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  27.55 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  31.15 
 
 		 601 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  29.18 
 
 		 417 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  27.25 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  30.35 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  30.93 
 
 		 459 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  28.25 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  31.18 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  30.06 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  26.87 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  30.3 
 
 		 395 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  29.97 
 
 		 430 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  28.37 
 
 		 438 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  29.37 
 
 		 410 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  29.46 
 
 		 430 aa  116  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  31.48 
 
 		 395 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.56 
 
 		 1018 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  28.41 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  30.56 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  28.2 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  27.58 
 
 		 424 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  26.51 
 
 		 408 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  31.62 
 
 		 591 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  27.18 
 
 		 440 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  29.34 
 
 		 785 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  27.35 
 
 		 407 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  29.2 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  32.29 
 
 		 5698 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  29.76 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  32.08 
 
 		 354 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  28.07 
 
 		 415 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.65 
 
 		 442 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  25.96 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  25.86 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  28.62 
 
 		 519 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  27.96 
 
 		 370 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  29.06 
 
 		 445 aa  109  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  28.31 
 
 		 447 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  28.37 
 
 		 395 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  28.27 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  29.89 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  30.65 
 
 		 440 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  26.46 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  30.84 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  27.71 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  28.27 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  27.3 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  28.46 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  30.77 
 
 		 510 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  26.97 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  29.79 
 
 		 498 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  31.03 
 
 		 790 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  30.68 
 
 		 379 aa  106  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  27.62 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  26.8 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  27.66 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  26.77 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  30.16 
 
 		 691 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  28.77 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  29.13 
 
 		 792 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  32.11 
 
 		 419 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  29.13 
 
 		 417 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>