138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0407 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0407  beta-lactamase  100 
 
 		 364 aa  729    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1815  beta-lactamase  37.6 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1161  beta-lactamase  39.74 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.580362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2416  beta-lactamase  40.46 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6382  beta-lactamase  36.73 
 
 		 472 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  27.24 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  26.3 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  25.26 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  26.89 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.48 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  25.19 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  25.37 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  24.91 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  24.42 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  25.57 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.71 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  25.57 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  24.24 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  25.42 
 
 		 524 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  26.43 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  26.43 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  23.85 
 
 		 315 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.77 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  24.34 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  25.63 
 
 		 483 aa  66.2  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  21.45 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  24.41 
 
 		 640 aa  63.5  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  27.91 
 
 		 503 aa  63.5  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  28.42 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  25.96 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  23.51 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  23.51 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  24.58 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.64 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  23.18 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  23.18 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  28.75 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  22.86 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  27.33 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.18 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  28.11 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  28.11 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  22.57 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  23.89 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  25.25 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  25.79 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  21.43 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.85 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  23.64 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2693  hypothetical protein  23.79 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000021247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  24.51 
 
 		 410 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2461  beta-lactamase  25 
 
 		 342 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00353647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2494  hypothetical protein  23.79 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.398655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2678  hypothetical protein  23.79 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373173  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  24.4 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2455  penicillin-binding protein  23.79 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.289032  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  25.86 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  25.18 
 
 		 468 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  28.2 
 
 		 335 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  26.78 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2744  hypothetical protein  23.79 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000646489  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  24.19 
 
 		 475 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3093  beta-lactamase  22.46 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2701  hypothetical protein  22.79 
 
 		 338 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0061  penicillin-binding protein  23.11 
 
 		 334 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0219  beta-lactamase  27.27 
 
 		 367 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  29.03 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  22.95 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2427  penicillin-binding protein  25.33 
 
 		 266 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.724018  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0081  penicillin-binding protein  24.65 
 
 		 343 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  20.64 
 
 		 384 aa  53.1  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  25.6 
 
 		 308 aa  53.1  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  24.26 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2609  hypothetical protein  23.08 
 
 		 338 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176051 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  23.31 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  23.68 
 
 		 462 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  25.66 
 
 		 522 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.23 
 
 		 445 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  21.99 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  21.17 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.08 
 
 		 443 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  23.91 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.66 
 
 		 439 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4979  beta-lactamase  23.45 
 
 		 356 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  26.47 
 
 		 505 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.6 
 
 		 468 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  25.32 
 
 		 359 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  24.72 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  24.82 
 
 		 421 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.79 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  24.22 
 
 		 504 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  31.39 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  24.82 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  25.91 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  21.62 
 
 		 530 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.91 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  24.82 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  31.39 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  21.45 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  24.82 
 
 		 416 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>