More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1284 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  100 
 
 		 462 aa  919    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  52.53 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  50.29 
 
 		 530 aa  348  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  44.06 
 
 		 483 aa  333  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  43.22 
 
 		 476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  49.72 
 
 		 530 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  46.97 
 
 		 505 aa  321  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  42.77 
 
 		 475 aa  319  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  44.79 
 
 		 640 aa  295  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  44.93 
 
 		 486 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  47.77 
 
 		 487 aa  245  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  44.03 
 
 		 503 aa  237  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  31.27 
 
 		 476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  28.99 
 
 		 524 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  28.48 
 
 		 598 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  29.93 
 
 		 363 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  35.23 
 
 		 308 aa  120  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  33.87 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  29.68 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  29.68 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  25.51 
 
 		 395 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  29.59 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  23.1 
 
 		 340 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.81 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  28.44 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  24.46 
 
 		 305 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  25.93 
 
 		 396 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3265  beta-lactamase  30.83 
 
 		 304 aa  97.1  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000437182  hitchhiker  0.000159955 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  24.37 
 
 		 305 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.33 
 
 		 419 aa  97.1  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  28.98 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  24.44 
 
 		 315 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  25.09 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  22.7 
 
 		 315 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.44 
 
 		 315 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  24.38 
 
 		 305 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  27.73 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  24.35 
 
 		 313 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.56 
 
 		 468 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  22.39 
 
 		 387 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  29.28 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.83 
 
 		 305 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  25.08 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  27.4 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  27.76 
 
 		 428 aa  91.3  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  23.67 
 
 		 309 aa  90.5  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  23.67 
 
 		 309 aa  90.5  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  22.39 
 
 		 315 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  22.39 
 
 		 315 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.03 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  29.37 
 
 		 328 aa  89.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  28.57 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  24.31 
 
 		 305 aa  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  24.66 
 
 		 315 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  26.28 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  26.76 
 
 		 397 aa  87.8  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  23.62 
 
 		 314 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  29.77 
 
 		 374 aa  87.8  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.85 
 
 		 425 aa  87.4  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  28.73 
 
 		 337 aa  87.4  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  26.84 
 
 		 405 aa  87.4  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  23.3 
 
 		 305 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  23.75 
 
 		 384 aa  87  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  23.53 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  26.77 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  23.85 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.02 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3093  beta-lactamase  26.62 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  25.98 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  31.1 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.23 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  27.67 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  27.27 
 
 		 522 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.89 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.92 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  31.08 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.13 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.52 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  25.48 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  25.32 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  25.39 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  27.21 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  26.07 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.88 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.55 
 
 		 419 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  25.71 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.2 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.64 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  27.67 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.37 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  29.73 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.37 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  27.36 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  28.22 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  25.97 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.79 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  27.3 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  26.32 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4979  beta-lactamase  26.01 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>