More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4279 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  100 
 
 		 400 aa  807    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  56.2 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  33.99 
 
 		 323 aa  141  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  29.45 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  29.84 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  28.3 
 
 		 530 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  27.08 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  26.74 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  32.33 
 
 		 503 aa  122  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  31.97 
 
 		 475 aa  122  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  26.39 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  28.21 
 
 		 505 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  27.49 
 
 		 530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.7 
 
 		 315 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.74 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  26.04 
 
 		 309 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  26.04 
 
 		 309 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  25.69 
 
 		 305 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.18 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  27.03 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  27.03 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.51 
 
 		 640 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  26.69 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  27.7 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.01 
 
 		 315 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  29.28 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  29.28 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.35 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  27.03 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  27.09 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  25.85 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  25.69 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  30 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  27.61 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  29.18 
 
 		 522 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  27.36 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  29.1 
 
 		 374 aa  106  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  26.22 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  27.64 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  29.18 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  26.24 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  28.13 
 
 		 598 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.38 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  26.4 
 
 		 328 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  26.18 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  28.33 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.24 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  26.26 
 
 		 371 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  29.53 
 
 		 459 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  27.57 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  28.62 
 
 		 481 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  27.47 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  28 
 
 		 327 aa  97.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  27.78 
 
 		 467 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  30.77 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  25.61 
 
 		 405 aa  96.7  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  26.67 
 
 		 363 aa  96.3  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  24.55 
 
 		 387 aa  96.3  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  27.78 
 
 		 473 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  29.53 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  25.7 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  27.78 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  27.78 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  27.59 
 
 		 475 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  28.12 
 
 		 467 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.18 
 
 		 425 aa  94  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  28.62 
 
 		 412 aa  93.6  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  26.57 
 
 		 371 aa  93.6  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  24.85 
 
 		 366 aa  93.6  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  24.59 
 
 		 387 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  27.78 
 
 		 462 aa  93.2  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  25.6 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  26.51 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  28.21 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  26.53 
 
 		 309 aa  90.9  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  25.76 
 
 		 368 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  28.28 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  25.95 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  27.27 
 
 		 468 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.88 
 
 		 476 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  27.56 
 
 		 466 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  25 
 
 		 382 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  27.21 
 
 		 362 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  27.22 
 
 		 504 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1124  beta-lactamase  30.6 
 
 		 346 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  27.27 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.02 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  25.77 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  26.74 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  25 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.95 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.96 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  27.3 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.17 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.17 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  26.12 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.92 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2416  beta-lactamase  29.3 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0777  beta-lactamase  27.74 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0135628  normal  0.105331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  24.54 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>