More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1949 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  100 
 
 		 486 aa  1007    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  47.4 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  44.33 
 
 		 530 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  44.56 
 
 		 530 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  54.52 
 
 		 640 aa  404  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  42.26 
 
 		 487 aa  317  4e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  44.93 
 
 		 462 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  46.82 
 
 		 483 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  44.02 
 
 		 504 aa  283  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  46.65 
 
 		 503 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  37.5 
 
 		 475 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  36.22 
 
 		 476 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  25.93 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.32 
 
 		 308 aa  153  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  32.26 
 
 		 524 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  31.08 
 
 		 363 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  28.43 
 
 		 598 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  28.81 
 
 		 397 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.51 
 
 		 340 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  31.41 
 
 		 323 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  25.81 
 
 		 305 aa  123  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  25.9 
 
 		 387 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  25.45 
 
 		 305 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  28.08 
 
 		 313 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  29.79 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.56 
 
 		 315 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  29.41 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  26.73 
 
 		 314 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  25.36 
 
 		 305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  28.08 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  26.88 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.94 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  30.67 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  25.7 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  26.33 
 
 		 389 aa  115  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  26.25 
 
 		 315 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  25.62 
 
 		 315 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  26.25 
 
 		 315 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  29.94 
 
 		 380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  29.94 
 
 		 380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  25.31 
 
 		 315 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  26.35 
 
 		 305 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  27.87 
 
 		 337 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  25.15 
 
 		 315 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  30.19 
 
 		 383 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  25.35 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  25.35 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  29.49 
 
 		 328 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  29.52 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25 
 
 		 305 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3265  beta-lactamase  30.42 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000437182  hitchhiker  0.000159955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  26.83 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.01 
 
 		 305 aa  106  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  27.64 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  30.56 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  29.56 
 
 		 401 aa  105  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  26.28 
 
 		 390 aa  103  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  31.38 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  31.29 
 
 		 333 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  28.08 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  31.03 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  30.04 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  30.25 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.05 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  28.62 
 
 		 337 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  27.81 
 
 		 456 aa  97.8  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  29.35 
 
 		 309 aa  97.8  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  27.78 
 
 		 338 aa  97.1  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  25.27 
 
 		 395 aa  97.4  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  27.64 
 
 		 384 aa  96.3  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  26.01 
 
 		 374 aa  94.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  27.3 
 
 		 382 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  26.97 
 
 		 366 aa  94.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  25.24 
 
 		 327 aa  94  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  28.81 
 
 		 383 aa  94  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  26.13 
 
 		 505 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  26.44 
 
 		 356 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  25.08 
 
 		 387 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  28.32 
 
 		 342 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  29.44 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  30.45 
 
 		 396 aa  91.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  29.27 
 
 		 359 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.42 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  27.57 
 
 		 335 aa  90.1  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.73 
 
 		 415 aa  90.5  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  28.91 
 
 		 360 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  29.23 
 
 		 359 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4500  beta-lactamase  25.4 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00711948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  29.02 
 
 		 378 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  28.67 
 
 		 342 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  26.5 
 
 		 466 aa  87.8  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  30.2 
 
 		 371 aa  87.8  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  25.17 
 
 		 378 aa  87.4  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  26.79 
 
 		 371 aa  87  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  29.23 
 
 		 362 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  28.45 
 
 		 432 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3093  beta-lactamase  28.21 
 
 		 333 aa  86.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.12 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  26.57 
 
 		 475 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>