237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4462 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  100 
 
 		 362 aa  725    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  87.47 
 
 		 378 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  86.91 
 
 		 359 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  78.89 
 
 		 360 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  64.35 
 
 		 359 aa  454  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  68.02 
 
 		 372 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  60.62 
 
 		 368 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  62.53 
 
 		 371 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  60.5 
 
 		 368 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  64.24 
 
 		 384 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  60.78 
 
 		 371 aa  418  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  46.41 
 
 		 432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  41.22 
 
 		 453 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  36.31 
 
 		 481 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  36.86 
 
 		 466 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  37.26 
 
 		 467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  37.46 
 
 		 467 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  36.47 
 
 		 473 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  36.47 
 
 		 473 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  36.59 
 
 		 473 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  35.26 
 
 		 456 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  35.11 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  35.69 
 
 		 475 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  37.14 
 
 		 472 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  31.79 
 
 		 378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  36.11 
 
 		 468 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  33.33 
 
 		 443 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  33.8 
 
 		 440 aa  142  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  28.29 
 
 		 449 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  34.5 
 
 		 459 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  33.45 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  30.48 
 
 		 491 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  32.77 
 
 		 374 aa  139  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  34.15 
 
 		 459 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  32.25 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  30.66 
 
 		 524 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  30.72 
 
 		 522 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.65 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.6 
 
 		 468 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  26.84 
 
 		 598 aa  116  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  28.57 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  31.29 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3570  beta-lactamase  33.01 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230187  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  29.01 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  29.32 
 
 		 640 aa  113  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  29.54 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  29.54 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  26.16 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  30.48 
 
 		 494 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.47 
 
 		 405 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  26.8 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  28.77 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.59 
 
 		 425 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  29.94 
 
 		 468 aa  106  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  28.78 
 
 		 505 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  28.94 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  26.89 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.34 
 
 		 449 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  31.27 
 
 		 374 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  30.18 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  27.13 
 
 		 530 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  27.42 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  29.97 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  26.93 
 
 		 416 aa  99.8  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.08 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  25.17 
 
 		 305 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  28.25 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  23.4 
 
 		 305 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  28.9 
 
 		 410 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  23.32 
 
 		 305 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  29.35 
 
 		 503 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  27.89 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  31.25 
 
 		 496 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  28.05 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  23.99 
 
 		 530 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  28.67 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  33.47 
 
 		 483 aa  92.8  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  27.97 
 
 		 387 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  31.97 
 
 		 396 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  28.8 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  29.23 
 
 		 486 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  28.08 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  30.36 
 
 		 497 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  27.39 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  26.64 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  31.23 
 
 		 447 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.63 
 
 		 467 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  22.7 
 
 		 305 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  28.97 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.77 
 
 		 467 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  29.77 
 
 		 475 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  31.07 
 
 		 323 aa  89.4  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  31.23 
 
 		 447 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  31.23 
 
 		 447 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  22.34 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  31.46 
 
 		 327 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  21.99 
 
 		 305 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  25.24 
 
 		 475 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  22.7 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  22.7 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>