258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2872 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  87.95 
 
 
472 aa  829    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  100 
 
 
475 aa  956    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  55.88 
 
 
453 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  53.56 
 
 
468 aa  481  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  55.1 
 
 
459 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  50.88 
 
 
443 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  50.33 
 
 
440 aa  443  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  49.89 
 
 
440 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  42.89 
 
 
467 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  42.19 
 
 
466 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  42.7 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  48.18 
 
 
473 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  48.18 
 
 
473 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  47.85 
 
 
473 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  47.19 
 
 
481 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3570  beta-lactamase  38.14 
 
 
479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230187  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  35.03 
 
 
456 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  31.83 
 
 
449 aa  225  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  32.61 
 
 
491 aa  223  7e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  35.57 
 
 
455 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  31.63 
 
 
468 aa  184  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.02 
 
 
468 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  34.75 
 
 
494 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  37.8 
 
 
374 aa  174  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  32.44 
 
 
522 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  38.67 
 
 
383 aa  171  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  34.53 
 
 
432 aa  160  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  34.92 
 
 
378 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  37.34 
 
 
360 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  35.03 
 
 
359 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  38.13 
 
 
371 aa  151  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  33.1 
 
 
496 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  34.59 
 
 
368 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  35.99 
 
 
359 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  34.93 
 
 
362 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  35.99 
 
 
378 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  36.56 
 
 
368 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  31.76 
 
 
497 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  36.07 
 
 
384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  37.54 
 
 
372 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  36.88 
 
 
371 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  28.67 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  32.05 
 
 
524 aa  113  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  29.02 
 
 
380 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  29.02 
 
 
380 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  29.24 
 
 
416 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  27.01 
 
 
383 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  29.07 
 
 
399 aa  103  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  30.22 
 
 
397 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  26.28 
 
 
384 aa  100  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  29.41 
 
 
328 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  30.35 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  30.74 
 
 
414 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  27.81 
 
 
396 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  29.23 
 
 
505 aa  93.6  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  26.91 
 
 
395 aa  93.6  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  26.27 
 
 
640 aa  91.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.3 
 
 
415 aa  91.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  27.49 
 
 
389 aa  89.7  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  27.86 
 
 
390 aa  89  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  28.67 
 
 
401 aa  88.2  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  28.38 
 
 
475 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  27.33 
 
 
413 aa  87.8  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  25.09 
 
 
382 aa  87.8  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.2 
 
 
476 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  27.49 
 
 
530 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.75 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  28.62 
 
 
505 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  26.33 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.75 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  25.93 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.08 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  32.18 
 
 
503 aa  84.7  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.08 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  26.55 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.75 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.75 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  29.35 
 
 
374 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.41 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.42 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  29.91 
 
 
530 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  29.3 
 
 
486 aa  80.9  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  28.01 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  26.52 
 
 
412 aa  79.7  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  26.64 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  25.77 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.5 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  27.56 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  28.57 
 
 
462 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.71 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  28.62 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.62 
 
 
467 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.94 
 
 
449 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.83 
 
 
419 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  25.74 
 
 
395 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.35 
 
 
395 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.28 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.94 
 
 
467 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4979  beta-lactamase  27.3 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  24.5 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>