253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1495 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  100 
 
 
456 aa  923    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  57.75 
 
 
491 aa  520  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  43.02 
 
 
466 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  40.63 
 
 
467 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  40.86 
 
 
473 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  40.86 
 
 
473 aa  296  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  40.86 
 
 
473 aa  296  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  40 
 
 
481 aa  292  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  41.18 
 
 
467 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  38.34 
 
 
453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  36.07 
 
 
449 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  37.61 
 
 
443 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  38.37 
 
 
455 aa  257  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  38.5 
 
 
468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  35.12 
 
 
440 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  35.71 
 
 
440 aa  242  7.999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  39.25 
 
 
468 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  42.33 
 
 
378 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  35.03 
 
 
475 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  34.38 
 
 
472 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  35.81 
 
 
459 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3570  beta-lactamase  35.29 
 
 
479 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230187  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  37.1 
 
 
374 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  41.1 
 
 
383 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  31.97 
 
 
468 aa  190  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  30.32 
 
 
522 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  31.22 
 
 
494 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  38.33 
 
 
371 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  38.95 
 
 
384 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  36.86 
 
 
432 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  34.63 
 
 
360 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  37.59 
 
 
368 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  35.95 
 
 
359 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  35.79 
 
 
371 aa  159  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  35.82 
 
 
368 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  35.26 
 
 
362 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  35.71 
 
 
372 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  34.15 
 
 
459 aa  146  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  34.73 
 
 
378 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  35.05 
 
 
359 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  31.64 
 
 
496 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  35.42 
 
 
497 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  29.05 
 
 
305 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  29.45 
 
 
395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  33.02 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  31.4 
 
 
405 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  27.04 
 
 
305 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  30.29 
 
 
389 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  27.18 
 
 
305 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  26.71 
 
 
305 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  26.1 
 
 
305 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  29.82 
 
 
397 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  31.16 
 
 
412 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  28.85 
 
 
366 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  27.6 
 
 
363 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  28.97 
 
 
416 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  25.82 
 
 
305 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  26.48 
 
 
305 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  26.1 
 
 
309 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  26.1 
 
 
309 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  28.62 
 
 
383 aa  107  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  30 
 
 
337 aa  107  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.69 
 
 
305 aa  106  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30 
 
 
405 aa  106  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.95 
 
 
419 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  27.03 
 
 
396 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.76 
 
 
305 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  30.56 
 
 
401 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.87 
 
 
640 aa  103  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.62 
 
 
425 aa  103  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  26.95 
 
 
598 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  31.14 
 
 
414 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  29.04 
 
 
389 aa  101  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  26.69 
 
 
387 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  30.77 
 
 
335 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  29.21 
 
 
505 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  27.65 
 
 
382 aa  99.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  27.37 
 
 
505 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  27.81 
 
 
486 aa  97.8  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  28.25 
 
 
530 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  28.93 
 
 
384 aa  97.1  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  28.26 
 
 
524 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  27.89 
 
 
413 aa  96.3  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  30.48 
 
 
335 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  29.87 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.51 
 
 
467 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  29.77 
 
 
338 aa  94.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  28.47 
 
 
328 aa  94.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  28.43 
 
 
530 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.25 
 
 
467 aa  94  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  29.36 
 
 
396 aa  94  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  27.27 
 
 
503 aa  93.6  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  32.36 
 
 
342 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  29.03 
 
 
374 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  31.15 
 
 
380 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  31.15 
 
 
380 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  30.5 
 
 
340 aa  91.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.76 
 
 
415 aa  91.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  29.14 
 
 
417 aa  90.5  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.6 
 
 
308 aa  90.1  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>