More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6049 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  100 
 
 
524 aa  1071    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  32.35 
 
 
305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.68 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  32.35 
 
 
309 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  32.35 
 
 
309 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  29.37 
 
 
530 aa  183  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  32.15 
 
 
305 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  31.39 
 
 
505 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  31.51 
 
 
305 aa  180  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  32.34 
 
 
305 aa  178  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  36.09 
 
 
503 aa  176  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.37 
 
 
305 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  31.35 
 
 
305 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  30.38 
 
 
640 aa  172  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  31.37 
 
 
305 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  32.03 
 
 
305 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  31.04 
 
 
340 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  29.33 
 
 
530 aa  163  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  30.5 
 
 
363 aa  161  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  33.74 
 
 
380 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  33.74 
 
 
380 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  33.44 
 
 
356 aa  156  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  32.26 
 
 
486 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  31.31 
 
 
315 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  30.3 
 
 
315 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  30.07 
 
 
328 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  30.98 
 
 
315 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  30.98 
 
 
315 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  29.97 
 
 
315 aa  146  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  30.3 
 
 
313 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  30.3 
 
 
315 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  32.41 
 
 
397 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  31.23 
 
 
374 aa  143  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  33.77 
 
 
323 aa  143  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  31.11 
 
 
504 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  31.8 
 
 
371 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  27.55 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  33.22 
 
 
337 aa  141  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  31.79 
 
 
389 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  31.96 
 
 
475 aa  140  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  29.29 
 
 
315 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  32.73 
 
 
483 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  28.97 
 
 
315 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  29.97 
 
 
384 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  28.92 
 
 
598 aa  136  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.82 
 
 
476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  29.07 
 
 
314 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  32.09 
 
 
360 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  31.02 
 
 
327 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  30.59 
 
 
335 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  30.13 
 
 
342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  31.95 
 
 
475 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  29 
 
 
400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  29.84 
 
 
387 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  30.95 
 
 
371 aa  126  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  31.73 
 
 
487 aa  126  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  28.99 
 
 
462 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  30.3 
 
 
366 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  30.84 
 
 
338 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  29.43 
 
 
342 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  29.82 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  31.38 
 
 
359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  29.91 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  30.42 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  31.69 
 
 
378 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  32.65 
 
 
362 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  28.74 
 
 
396 aa  117  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  32.05 
 
 
475 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  28.62 
 
 
337 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  31.19 
 
 
472 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  31.37 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  29.14 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  28.65 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  30.46 
 
 
401 aa  111  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  27.38 
 
 
359 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  29.25 
 
 
368 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  29.91 
 
 
432 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  28.23 
 
 
346 aa  107  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  28.23 
 
 
353 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  27.04 
 
 
378 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  26.47 
 
 
383 aa  104  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.38 
 
 
397 aa  103  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  25.36 
 
 
449 aa  103  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  29.37 
 
 
384 aa  103  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  29.97 
 
 
416 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.57 
 
 
443 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  30.28 
 
 
468 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.87 
 
 
442 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  22.86 
 
 
476 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.5 
 
 
308 aa  100  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  27.89 
 
 
473 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.79 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  27.89 
 
 
473 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  27.89 
 
 
473 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  29.07 
 
 
481 aa  99.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.63 
 
 
467 aa  98.6  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  28.03 
 
 
389 aa  98.6  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  29.67 
 
 
468 aa  98.2  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  28.72 
 
 
467 aa  97.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.21 
 
 
468 aa  97.4  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>