283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0635 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  100 
 
 		 327 aa  651    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  50.78 
 
 		 374 aa  307  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  48.43 
 
 		 328 aa  302  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  47.15 
 
 		 366 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  39.29 
 
 		 380 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  39.29 
 
 		 380 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  34.51 
 
 		 475 aa  159  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  28.01 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  28.66 
 
 		 305 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  32.78 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  31.02 
 
 		 524 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  28.34 
 
 		 305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  27.78 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  27.04 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  26.25 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  27.15 
 
 		 387 aa  135  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  25.41 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  25.41 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  25.08 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  26.9 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  26.54 
 
 		 598 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.08 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.73 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  33.22 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.22 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  31.8 
 
 		 475 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  29.14 
 
 		 397 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  27.46 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  29.61 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  28.77 
 
 		 640 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  30.99 
 
 		 346 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  29.63 
 
 		 328 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  31.34 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  28.67 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  23.68 
 
 		 387 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  27.72 
 
 		 342 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  30.59 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  26.51 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  28.29 
 
 		 338 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.07 
 
 		 476 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  30.8 
 
 		 401 aa  102  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  28.18 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  29.76 
 
 		 481 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  25.23 
 
 		 530 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  28.57 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  25.55 
 
 		 486 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  23.34 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  29.37 
 
 		 473 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  29.37 
 
 		 473 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  29.17 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  27.1 
 
 		 356 aa  99.8  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  22.88 
 
 		 315 aa  99  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  21.93 
 
 		 313 aa  99  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  28.03 
 
 		 503 aa  98.6  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  27.82 
 
 		 396 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  26.51 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  22.77 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  27.65 
 
 		 467 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  25.9 
 
 		 530 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  22.09 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  29.59 
 
 		 459 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  28.96 
 
 		 466 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  27.68 
 
 		 335 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  26.69 
 
 		 505 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  25.57 
 
 		 383 aa  96.7  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  28 
 
 		 400 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  30.07 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  22.19 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  28.17 
 
 		 467 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  30.92 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  26.35 
 
 		 505 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  30.74 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  25.98 
 
 		 399 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  21.51 
 
 		 315 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  21.51 
 
 		 315 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  26.97 
 
 		 368 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03703  hypothetical protein  44.76 
 
 		 116 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.505696  normal  0.773408 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  22.67 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  23.29 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  28.42 
 
 		 417 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  27.21 
 
 		 443 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  26.99 
 
 		 472 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  31.7 
 
 		 362 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  28.47 
 
 		 412 aa  89.7  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.36 
 
 		 308 aa  89.4  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  26.83 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  31.58 
 
 		 487 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  25.73 
 
 		 359 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  27.8 
 
 		 504 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  29.56 
 
 		 359 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  25.33 
 
 		 368 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  28.4 
 
 		 468 aa  85.9  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  27.21 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  27.09 
 
 		 475 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  29.37 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  28.18 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  24.12 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03702  hypothetical protein  34.81 
 
 		 139 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.255314  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3093  beta-lactamase  31.36 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>