186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1128 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  100 
 
 
337 aa  681    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  54.58 
 
 
338 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  52.46 
 
 
356 aa  318  6e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  49.7 
 
 
335 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  49.54 
 
 
342 aa  308  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  49.85 
 
 
342 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  52.9 
 
 
337 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  50.17 
 
 
346 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  50.17 
 
 
353 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  50 
 
 
333 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  50.18 
 
 
389 aa  275  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  44.59 
 
 
328 aa  269  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  32.88 
 
 
305 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  37.91 
 
 
323 aa  166  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  31.44 
 
 
363 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  30 
 
 
305 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  28.97 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  29.66 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  29.66 
 
 
305 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  30.04 
 
 
305 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  28.62 
 
 
309 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.62 
 
 
305 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  28.62 
 
 
309 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  29.22 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  33.22 
 
 
524 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  28.28 
 
 
305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  29.35 
 
 
315 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.59 
 
 
305 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  28.87 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  29.01 
 
 
315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  27.33 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  28.33 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  28.33 
 
 
315 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  29.24 
 
 
530 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  28.82 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  28.42 
 
 
314 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  27.99 
 
 
315 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  27.99 
 
 
315 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  29.15 
 
 
503 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  26.43 
 
 
530 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.61 
 
 
640 aa  112  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  27.87 
 
 
486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  27.67 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  29.2 
 
 
475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  30 
 
 
456 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  28.07 
 
 
598 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  32.06 
 
 
483 aa  105  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  28.76 
 
 
327 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  26.97 
 
 
505 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  25.43 
 
 
387 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  28.67 
 
 
374 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.26 
 
 
476 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  28.25 
 
 
380 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  28.25 
 
 
380 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  27.07 
 
 
387 aa  94  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  24.61 
 
 
384 aa  94.4  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  26.2 
 
 
504 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  28.33 
 
 
371 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  28.91 
 
 
487 aa  89.4  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  28.47 
 
 
378 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  27.46 
 
 
384 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  25.89 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  28.73 
 
 
462 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  28.85 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  25.54 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.25 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  28.83 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  26.45 
 
 
505 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  26.92 
 
 
366 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  24.23 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  27.83 
 
 
475 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  26.35 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  20.39 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  25.45 
 
 
372 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  23.51 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  26.42 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  26.06 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  28.12 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  29.88 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.1 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  29.43 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  29.3 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  26.13 
 
 
473 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  26.13 
 
 
473 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.61 
 
 
425 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  24.73 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  25.81 
 
 
473 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  25.5 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  23.76 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.76 
 
 
419 aa  69.3  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  25.9 
 
 
491 aa  69.3  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0219  beta-lactamase  29.36 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  27.1 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  25.82 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  25.94 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  25.93 
 
 
459 aa  67.4  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.59 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.35 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.29 
 
 
468 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  24.85 
 
 
455 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>