172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3388 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  100 
 
 		 342 aa  693    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  88.6 
 
 		 342 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  70.06 
 
 		 335 aa  482  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  67.5 
 
 		 338 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  61.8 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  49.54 
 
 		 337 aa  309  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  45.64 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  47.7 
 
 		 389 aa  255  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  45.14 
 
 		 346 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  44.44 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  46.53 
 
 		 333 aa  238  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  40.06 
 
 		 328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  33.45 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  35.6 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  28.62 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  29 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  29.15 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  31.62 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  30.8 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  29.25 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  29.15 
 
 		 315 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  28.66 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  28.66 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  31.96 
 
 		 305 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  30.93 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.73 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  30.05 
 
 		 524 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  29.11 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  28.47 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  27.59 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  30.1 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  30.1 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  30.24 
 
 		 305 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.19 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.1 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  31.07 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  30.03 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  29.26 
 
 		 530 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  30.63 
 
 		 503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  28.66 
 
 		 530 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  28.22 
 
 		 598 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  29.05 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  28.16 
 
 		 366 aa  96.3  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  26.28 
 
 		 640 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  29.89 
 
 		 505 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  26.92 
 
 		 387 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  27.88 
 
 		 475 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  27.72 
 
 		 327 aa  92.4  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  25 
 
 		 387 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  30.06 
 
 		 456 aa  90.1  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  28.08 
 
 		 380 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  28.08 
 
 		 380 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  27.84 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.01 
 
 		 476 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  28.32 
 
 		 486 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  28.18 
 
 		 371 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  26.21 
 
 		 309 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  30.47 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  30.22 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  25.43 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  26.18 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  27.33 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  26.84 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  26.5 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  24.74 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  26.19 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  28.14 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  24.34 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  28.93 
 
 		 504 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  29.74 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  28.62 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  26.54 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  24.72 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  27.99 
 
 		 443 aa  76.3  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  25.96 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  26.76 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  27.81 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  27.73 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  25.93 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  26.43 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  29.15 
 
 		 462 aa  73.2  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  24.84 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  27.99 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  24.84 
 
 		 440 aa  72.8  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  26 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  24.68 
 
 		 476 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.89 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  25.08 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  27.07 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  28.16 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  23.84 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  27.69 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.34 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  24.44 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  26.03 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  25.94 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  27.45 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  26.84 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  27.45 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  25.71 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>