161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1250 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  100 
 
 		 338 aa  677    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  64.67 
 
 		 335 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  68.51 
 
 		 342 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  67.94 
 
 		 342 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  61.01 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  54.58 
 
 		 337 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  44.24 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  50.17 
 
 		 389 aa  259  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  45.54 
 
 		 346 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  44.95 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  45.21 
 
 		 353 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  40.51 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  33.89 
 
 		 363 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  36.51 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  29.65 
 
 		 313 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  29.58 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  29.38 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  29.75 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  29.56 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  31.21 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  30.82 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  30.99 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  30.61 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  28.48 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  28.48 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  30.66 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  30.16 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  30.1 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  30.1 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  28.08 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  28.39 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  30.31 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  27.9 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  29.41 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.41 
 
 		 305 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.41 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  30.49 
 
 		 524 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  28.76 
 
 		 530 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  32.11 
 
 		 503 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  28.29 
 
 		 530 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  24.29 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  26.82 
 
 		 598 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  29.62 
 
 		 475 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  27.78 
 
 		 486 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  28.86 
 
 		 505 aa  95.9  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.39 
 
 		 476 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  29.77 
 
 		 456 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  28.29 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  30.54 
 
 		 475 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  30.39 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  32.27 
 
 		 380 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  32.27 
 
 		 380 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  26.4 
 
 		 640 aa  90.9  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  24.26 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  26.98 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  30.74 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  26.06 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  24.57 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  24.61 
 
 		 401 aa  75.9  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  27.33 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  24.35 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  26.62 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  27.33 
 
 		 453 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  27.3 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  25.91 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  25.09 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.32 
 
 		 308 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  27.13 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  26.47 
 
 		 468 aa  69.3  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  26.46 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  27.05 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  28.05 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  28.2 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  28.2 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  26.86 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  27.7 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  29.55 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.99 
 
 		 468 aa  66.6  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  24.51 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  27.21 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.02 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  26.73 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  27.51 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  26.35 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  28.21 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  27.54 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.05 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  26.56 
 
 		 481 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.56 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.56 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  23.95 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  26.35 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  23.95 
 
 		 440 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  25.23 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  26.35 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  27.39 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.56 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  27.46 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.92 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.1 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>