More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0652 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  100 
 
 		 383 aa  758    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  51.67 
 
 		 374 aa  361  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  43.42 
 
 		 466 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  43.75 
 
 		 467 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  43.56 
 
 		 473 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  44.85 
 
 		 481 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  43.56 
 
 		 473 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  43.56 
 
 		 473 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  43.28 
 
 		 467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  37.7 
 
 		 378 aa  210  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  43.17 
 
 		 468 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  41.75 
 
 		 456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  42.76 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  41.3 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  38.31 
 
 		 449 aa  190  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  38.96 
 
 		 459 aa  183  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  39.26 
 
 		 455 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  38.08 
 
 		 432 aa  179  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  37.54 
 
 		 491 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  38.36 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  39.1 
 
 		 440 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  36 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  38.75 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  39.07 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  38.24 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  39.07 
 
 		 475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  39.34 
 
 		 371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  37.35 
 
 		 371 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  35.74 
 
 		 360 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  36.72 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  36.18 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  36.73 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  34.98 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  30.31 
 
 		 522 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  36.19 
 
 		 359 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  36.51 
 
 		 378 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  33.22 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  31.73 
 
 		 494 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  34.01 
 
 		 468 aa  133  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  29.85 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  34.04 
 
 		 496 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  31.51 
 
 		 397 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.06 
 
 		 415 aa  119  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  32.28 
 
 		 497 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  30.36 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  32.08 
 
 		 410 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3570  beta-lactamase  33.14 
 
 		 479 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230187  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.48 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  28.82 
 
 		 530 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  29.74 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  27.55 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  27.02 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  29.68 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  31.79 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  28.33 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  28.3 
 
 		 399 aa  99.8  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  29.5 
 
 		 389 aa  99.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.71 
 
 		 467 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  29.67 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.71 
 
 		 449 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.77 
 
 		 452 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.16 
 
 		 467 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  26.56 
 
 		 640 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  31.25 
 
 		 524 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.4 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  28.81 
 
 		 486 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  27.4 
 
 		 305 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  27.72 
 
 		 530 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.94 
 
 		 443 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  26.82 
 
 		 383 aa  90.9  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  27.65 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  28.38 
 
 		 401 aa  90.1  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  26.79 
 
 		 389 aa  89.4  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  30.51 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  26.13 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  26.86 
 
 		 505 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.9 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  24.05 
 
 		 313 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  25.68 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  29.87 
 
 		 417 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  26.8 
 
 		 363 aa  86.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  26.43 
 
 		 397 aa  86.3  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  24.52 
 
 		 315 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  25.43 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  23.87 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  28.85 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  25.78 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  25.88 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  24.36 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  28.38 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.68 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  24.32 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.66 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  24.66 
 
 		 309 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  25.09 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  24.66 
 
 		 309 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  28.43 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  23.15 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.87 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  29.65 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>