More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5881 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  81.3 
 
 		 476 aa  773    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  100 
 
 		 475 aa  949    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  41.67 
 
 		 462 aa  312  9e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  39.22 
 
 		 530 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  37.5 
 
 		 486 aa  276  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  36.72 
 
 		 505 aa  275  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  35.04 
 
 		 530 aa  272  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  38.68 
 
 		 483 aa  271  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  38.23 
 
 		 504 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  43.67 
 
 		 503 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  39.31 
 
 		 640 aa  246  6.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  43.15 
 
 		 487 aa  220  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  28.5 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  31.96 
 
 		 524 aa  140  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33 
 
 		 308 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  32.04 
 
 		 323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  30.4 
 
 		 363 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  28.99 
 
 		 380 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  28.99 
 
 		 380 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.85 
 
 		 340 aa  117  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  29.49 
 
 		 397 aa  114  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3265  beta-lactamase  33.58 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000437182  hitchhiker  0.000159955 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  29.2 
 
 		 337 aa  110  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  31.42 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  27.72 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  29.8 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  22.15 
 
 		 309 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  22.15 
 
 		 309 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.48 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.48 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  25 
 
 		 598 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  22.67 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  21.59 
 
 		 305 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  29.69 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  22.15 
 
 		 305 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  22.4 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  26.95 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  30.94 
 
 		 328 aa  100  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  27.57 
 
 		 335 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  29.62 
 
 		 338 aa  100  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  21.59 
 
 		 305 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  27.54 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  26.79 
 
 		 416 aa  98.2  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  22.6 
 
 		 305 aa  97.8  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  21.82 
 
 		 305 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  24.7 
 
 		 313 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  24.58 
 
 		 384 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  22.08 
 
 		 305 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.27 
 
 		 396 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  28.67 
 
 		 378 aa  95.9  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  28.89 
 
 		 473 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  24.36 
 
 		 395 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  28.89 
 
 		 473 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  27.27 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  26.37 
 
 		 328 aa  95.1  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  29.05 
 
 		 472 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  27.64 
 
 		 389 aa  94  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  26.8 
 
 		 371 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4500  beta-lactamase  24.53 
 
 		 421 aa  94  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00711948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  27.36 
 
 		 481 aa  94  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  25.5 
 
 		 314 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  28.29 
 
 		 372 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  23.62 
 
 		 315 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  26.25 
 
 		 374 aa  93.2  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  27.8 
 
 		 374 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  28.42 
 
 		 342 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  22.8 
 
 		 315 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  27.44 
 
 		 473 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  29.41 
 
 		 467 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  22.53 
 
 		 315 aa  91.3  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  24.57 
 
 		 315 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  25.24 
 
 		 368 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  27.5 
 
 		 401 aa  90.9  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  23.7 
 
 		 315 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  31.7 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  25.83 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  23.13 
 
 		 315 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  26.57 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.23 
 
 		 578 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  28.38 
 
 		 475 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  26.71 
 
 		 342 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  28.57 
 
 		 467 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  24.28 
 
 		 368 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  22.18 
 
 		 315 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  22.18 
 
 		 315 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  27.49 
 
 		 456 aa  87  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  27.22 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  27.36 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  32.66 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  24.29 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  24.5 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  22.68 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.52 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  25.83 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.58 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  30 
 
 		 404 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.67 
 
 		 415 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  24.48 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.38 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.07 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>