More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0869 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 		 443 aa  905    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  66.89 
 
 		 452 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  66.5 
 
 		 467 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  66.5 
 
 		 467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  65.22 
 
 		 444 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  67.18 
 
 		 397 aa  551  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  59.61 
 
 		 445 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  52.17 
 
 		 442 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  51.92 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  50.26 
 
 		 442 aa  398  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  44.72 
 
 		 439 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  44.58 
 
 		 448 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  47.39 
 
 		 408 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  46.14 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  46.21 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  41.67 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  41.67 
 
 		 395 aa  268  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.98 
 
 		 446 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.84 
 
 		 419 aa  246  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.96 
 
 		 419 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.22 
 
 		 419 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.69 
 
 		 419 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.22 
 
 		 419 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.84 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.38 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.99 
 
 		 450 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.69 
 
 		 419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.29 
 
 		 397 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.69 
 
 		 419 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.69 
 
 		 419 aa  236  9e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.72 
 
 		 420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.08 
 
 		 439 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.51 
 
 		 419 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.96 
 
 		 385 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.96 
 
 		 385 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.25 
 
 		 385 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  34.74 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.57 
 
 		 444 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.45 
 
 		 430 aa  206  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.91 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  31.65 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.63 
 
 		 391 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.3 
 
 		 387 aa  179  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  30.95 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  31.1 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.59 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  34.71 
 
 		 389 aa  166  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  34.06 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  32.89 
 
 		 450 aa  163  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  31 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  33.33 
 
 		 401 aa  156  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.27 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  31.89 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.88 
 
 		 449 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  30.5 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  31.68 
 
 		 446 aa  143  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  31.33 
 
 		 414 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  29.97 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  29.66 
 
 		 416 aa  136  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.08 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  24.86 
 
 		 421 aa  131  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  31.27 
 
 		 447 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  30.58 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  29.82 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  29.83 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  29.83 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  31.47 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  28.88 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  27.97 
 
 		 410 aa  120  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  30.18 
 
 		 396 aa  117  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  28.57 
 
 		 524 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  27.7 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  25 
 
 		 384 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  28.52 
 
 		 417 aa  100  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  25.34 
 
 		 371 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  28.01 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  26.74 
 
 		 382 aa  97.8  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  23.84 
 
 		 384 aa  96.3  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  29.78 
 
 		 505 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1842  hypothetical protein  26.28 
 
 		 457 aa  94  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  29.41 
 
 		 640 aa  94  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.02 
 
 		 396 aa  93.6  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  26.81 
 
 		 503 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  28.48 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  25.32 
 
 		 371 aa  91.3  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  26.18 
 
 		 530 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  28.39 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  24.92 
 
 		 368 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  26.23 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  26.23 
 
 		 315 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  26.01 
 
 		 359 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  27.85 
 
 		 473 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.5 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  26.54 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.9 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  27.85 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  27.84 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  27.85 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  26.67 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>