262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1945 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 
430 aa  882    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  64.22 
 
 
448 aa  566  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  60.94 
 
 
439 aa  550  1e-155  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  62.71 
 
 
446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  53.04 
 
 
442 aa  485  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  55.08 
 
 
449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  53.98 
 
 
445 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  48.46 
 
 
467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  48.69 
 
 
467 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  49.63 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  48.08 
 
 
452 aa  395  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  46.14 
 
 
443 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  48.77 
 
 
397 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  43.34 
 
 
408 aa  330  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  42.79 
 
 
442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.62 
 
 
410 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.65 
 
 
446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.98 
 
 
395 aa  232  8.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.16 
 
 
397 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.25 
 
 
419 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.11 
 
 
419 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.11 
 
 
419 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.03 
 
 
419 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.55 
 
 
419 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.63 
 
 
419 aa  209  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.46 
 
 
419 aa  209  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.29 
 
 
419 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.78 
 
 
419 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  36.48 
 
 
415 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.63 
 
 
419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.29 
 
 
385 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.29 
 
 
385 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.73 
 
 
420 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  33.25 
 
 
389 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.55 
 
 
385 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.26 
 
 
439 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.18 
 
 
391 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.62 
 
 
452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.56 
 
 
450 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.33 
 
 
444 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.28 
 
 
387 aa  160  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  30.56 
 
 
405 aa  153  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.65 
 
 
419 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.34 
 
 
430 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.2 
 
 
405 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.22 
 
 
449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  29.09 
 
 
431 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  26.98 
 
 
395 aa  142  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  29.67 
 
 
414 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  29.93 
 
 
389 aa  136  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  28.2 
 
 
426 aa  136  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  28.73 
 
 
450 aa  136  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  29.43 
 
 
414 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.81 
 
 
425 aa  133  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.39 
 
 
449 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  28.81 
 
 
446 aa  126  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  27.48 
 
 
505 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.52 
 
 
415 aa  121  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  30.19 
 
 
396 aa  120  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  27.7 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  30 
 
 
410 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  28.45 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  27.83 
 
 
412 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  26.65 
 
 
421 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  27.12 
 
 
416 aa  110  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  25.96 
 
 
404 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  23.78 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  27.67 
 
 
405 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  25.08 
 
 
447 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  25.08 
 
 
447 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  25.08 
 
 
447 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  24.34 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  26.26 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2115  Beta-lactamase  24.58 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269149  normal  0.194976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  27.36 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  26.48 
 
 
640 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  26.23 
 
 
383 aa  82  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  25.93 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  27.05 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  28.53 
 
 
481 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  26.12 
 
 
524 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  24.58 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  27.01 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  26.18 
 
 
456 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  27.19 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  24.91 
 
 
530 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  25.17 
 
 
598 aa  76.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  26.22 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  26.56 
 
 
467 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  26.69 
 
 
473 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  26.69 
 
 
473 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  28 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  26.14 
 
 
467 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1842  hypothetical protein  25.48 
 
 
457 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  25.16 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  26.03 
 
 
455 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.37 
 
 
468 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  22.97 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  24.5 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  26.37 
 
 
466 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>